کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8270327 | 1534971 | 2014 | 9 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Quantitative label-free redox proteomics of reversible cysteine oxidation in red blood cell membranes
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
SGEQ-TOFICATCysPMSFRBCpKaGSHN-ethylmaleimideDTTBiotin-HPDPN-[6-(biotinamido)hexyl]-3′-(2′-pyridyldithio)propionamideIAANESIHEPESG3PDHDDACRAPRed blood cells - سلولهای قرمز خون4-(2-hydroxyethyl)-1-piperazineethanesulfonic acid - 4- (2-hydroxyethyl) -1-piperazineethanesulfonic acidBSA - BSAbovine serum albumin - آلبومین سرم گاوEDTA - اتیلن دی آمین تترا استیک اسید Ethylenediaminetetraacetic acid - اتیلینیدامین تتراستیک اسیدacid dissociation constant - ثابت جداسازی اسیدDisulfides - دیسولفیدdithiothreitol - دیتیوتریتولquadrupole time-of-flight - زمان پرواز چهار روزهCysteine - سیستئینMass spectrometry - طیف سنجی جرمیRed blood cell membrane - غشاء گلبول قرمزphenylmethylsulfonyl fluoride - فنیل متیل سولفونیل فلورایدisotope-coded affinity tag - نشانه وابستگی ایزوتوپ کد شدهNEM - نهRedox proteomics - پروتویمیک ردوکسCHAPS - چاپسliquid chromatography - کروماتوگرافی مایعHPLC - کروماتوگرافی مایعی کاراdata-dependent acquisition - کسب اطلاعات وابسته به داده هاGlutathione - گلوتاتیونglyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase - گلیسرالیدید-3-فسفات دهیدروژنازiodoacetamide - یووداکتامید
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
سالمندی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Reversible oxidation of cysteine residues is a relevant posttranslational modification of proteins. However, the low activation energy and transitory nature of the redox switch and the intrinsic complexity of the analysis render quite challenging the aim of a rigorous high-throughput screening of the redox status of redox-sensitive cysteine residues. We describe here a quantitative workflow for redox proteomics, where the ratio between the oxidized forms of proteins in the control vs treated samples is determined by a robust label-free approach. We critically present the convenience of the procedure by specifically addressing the following aspects: (i) the accurate ratio, calculated from the whole set of identified peptides rather than just isotope-tagged fragments; (ii) the application of a robust analytical pipeline to frame the most consistent data averaged over the biological variability; (iii) the relevance of using stringent criteria of analysis, even at the cost of losing potentially interesting but statistically uncertain data. The pipeline has been assessed on red blood cell membrane challenged with diamide as a model of a mild oxidative condition. The cluster of identified proteins encompassed components of the cytoskeleton more oxidized. Indirectly, our analysis confirmed the previous observation that oxidized hemoglobin binds to membranes while oxidized peroxiredoxin 2 loses affinity.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Free Radical Biology and Medicine - Volume 71, June 2014, Pages 90-98
Journal: Free Radical Biology and Medicine - Volume 71, June 2014, Pages 90-98
نویسندگان
Mattia Zaccarin, Marco Falda, Antonella Roveri, Valentina Bosello-Travain, Luciana Bordin, Matilde Maiorino, Fulvio Ursini, Stefano Toppo,