کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5906064 | 1159947 | 2014 | 12 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Analysis of changes in transcription start site distribution by a classification approach
ترجمه فارسی عنوان
تجزیه و تحلیل تغییرات در توزیع سایت شروع رونویسی با یک روش طبقه بندی
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
TAK1LSAMPTLR4SOCS1IL6IFIT1IRFUSP18TBK1ISG15TRAF family member-associated NF-κB activatorNF-κBMouse dendritic cellsTRAFIKZF1NRXN1Fibroblast growth factor 14STAT5ARIP1Ubiquitin-like modifierFGF14MYD88TTRTSSinhibitor of kappa B kinaseinterleukin receptor-associated kinaseubiquitin specific peptidase 18TSCAP-1Gadd45gLPSIKKGM-CSFcDNA - cDNADNA complementary to RNA - DNA مکمل RNAJAK/STAT - JAK / STATMAPK - MAPKTRIF - Trif بهchromatin immunoprecipitation - ایمن سازی کروماتینInterleukin 27 - اینترلوکین 27interleukin 6 - اینترلوکین 6cap analysis of gene expression - تجزیه و تحلیل چگالی بیان ژنTTR, Transthyretin - ترانستیرتینtumor necrosis factor alpha - تومور نکروز عامل آلفاTANK-binding kinase 1 - تین کیناز 1transcription start site - رونویسی شروع سایتStatistical approach - رویکرد آماریsuppressor of cytokine signaling 1 - سرکوب کننده سیگنالینگ سیتوکین 1IRAK - عراقTNF-α - فاکتور نکروز توموری آلفاnuclear factor kappa B - فاکتور هسته ای کاپا Bcage - قفسlipopolysaccharide - لیپوپلی ساکاریدAlternative promoters - مؤسسات جایگزینgranulocyte macrophage colony-stimulating factor - ماکروفاژ گرانولوسیت عامل کلونی تحریک کنندهtank - مخزنmyeloid differentiation primary response gene 88 - پاسخ اولیه ژن 88، اختلال میلوئیدLimbic system-associated membrane protein - پروتئین غشای مرتبط با سیستم لیمبیmitogen-activated protein kinase - پروتئین کیناز فعال با mitogenCHiP - چیپjanus kinase/signal transducers and activators of transcription - ژنوس کیناز / فرستنده های سیگنال و فعال کننده های رونویسیJun proto-oncogene - ژوئن پروتنوکژنVoltage-gated potassium channel - کانال پتاسیم با ولتاژToll-like receptor 4 - گیرنده تله مانند 4
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
چکیده انگلیسی
Change in transcription start site (TSS) usage is an important mechanism for the control of transcription process, and has a significant effect on the isoforms being transcribed. One of the goals in the study of TSS is the understanding of how and why their usage differs in different tissues or under different conditions. In light of recent efforts in the mapping of transcription start site landscape using high-throughput sequencing approaches, a quantitative and automated method is needed to process all the data that are being produced. In this work we propose a statistical approach that will classify changes in TSS distribution between different samples into several categories of changes that may have biological significance. Genes selected by the classifiers can then be analyzed together with additional supporting data to determine their biological significance. We use a set of time-course TSS data from mouse dendritic cells stimulated with lipopolysaccharide (LPS) to demonstrate the usefulness of our method.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 537, Issue 1, 1 March 2014, Pages 29-40
Journal: Gene - Volume 537, Issue 1, 1 March 2014, Pages 29-40
نویسندگان
Kuo-ching Liang, Yutaka Suzuki, Yutaro Kumagai, Kenta Nakai,