کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5905861 | 1159942 | 2014 | 11 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Exploring the interaction between small RNAs and R genes during Brachypodium response to Fusarium culmorum infection
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
primary microRNAIPTGRT-qPCRdeoxyribonucleaseGSSNBSX-GalDCLpri-miRNAFHBLRRmiRNA*RNaseBrachypodium distachyonR genesprecursor miRNArRNA5-bromo-4-chloro-3-indolyl β-d-galactopyranosideABAgDNAmRNAcDNA - cDNADNA complementary to RNA - DNA مکمل RNAgenomic DNA - DNA ژنومیDNA - DNA یا اسید دزوکسی ریبونوکلئیکDNAse - DNAasemessenger RNA - RNA messengerRibosomal RNA - RNA RibosomalSmall interfering RNA - RNA تداخل کوچکsiRNA - siRNABLAST, basic local alignment search tool - ابزار پایهای برای جستجوی برهم نهیهای موضعی، بلاستEthylene - اتیلنEST - استdeoxyribonucleic acid - اسید deoxyribonucleicabscisic acid - اسید آبسزیکjasmonic acid - اسید جاسونیکRNA - اسید ریبونوکلئیکribonucleic acid - اسید ریبونوکلئیکSalicylic acid - اسید سالیسیلیکBlast - انفجارisopropyl β-D-thiogalactopyranoside - ایزوپروپیل β-D-thiogalactopyranosidePlant disease - بیماری های گیاهیanalysis of variance - تحلیل واریانسANOVA - تحلیل واریانس Analysis of varianceReverse transcriptase - ترانس کریپتاز معکوس یا وارونویسcoding sequence - توالی کدگذاریExpressed Sequence Tag - تکرار اظهار نظرLeucine rich repeat - تکرار غنی از لوسینbase pairs - جفت پایهRISC - خطرMelting Temperature - دمای ذوبdouble-stranded - دو رشتهribonuclease - ریبونوکلئازnucleotide binding site - سایت پیوند نوکلئوتیدFusarium head blight - سر Fusarium سرگیجه داردUTR یا untranslated regions - منطقه ترجمه نشدهuntranslated region - منطقه غیر ترجمهMicroRNA - میکرو RNA MiRNA - میکروRNA، ریزآرانای، miRNANucleotides - نوکلئوتیدpolymerase chain reaction - واکنش زنجیره ای پلیمرازPCR - واکنش زنجیرهٔ پلیمرازHypersensitive response - پاسخ حساسیتpre-miRNA - پیش از miRNAResistance genes - ژن مقاومتCdS - کادمیم سولفید، سولفید کادمیم
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
The present study aims to investigate small RNA interactions with putative disease response genes in the model grass species Brachypodium distachyon. The fungal pathogen Fusarium culmorum (Fusarium herein) and phytohormone salicylic acid treatment were used to induce the disease response in Brachypodium. Initially, 121 different putative disease response genes were identified using bioinformatic and homology based approaches. Computational prediction was used to identify 33 candidate new miRNA coding sequences, of which 9 were verified by analysis of small RNA sequence libraries. Putative Brachypodium miRNA target sites were identified in the disease response genes, and a subset of which were screened for expression and possible miRNA interactions in 5 different Brachypodium lines infected with Fusarium. An NBS-LRR family gene, 1g34430, was polymorphic among the lines, forming two major genotypes, one of which has its miRNA target sites deleted, resulting in altered gene expression during infection. There were siRNAs putatively involved in regulation of this gene, indicating a role of small RNAs in the B. distachyon disease response.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 536, Issue 2, 25 February 2014, Pages 254-264
Journal: Gene - Volume 536, Issue 2, 25 February 2014, Pages 254-264
نویسندگان
Stuart James Lucas, Kubilay BaÅtaÅ, Hikmet Budak,