کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8470447 | 1549979 | 2018 | 8 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Temporal transcriptome analysis of the white-rot fungus Obba rivulosa shows expression of a constitutive set of plant cell wall degradation targeted genes during growth on solid spruce wood
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
PCPBGLCAZyAOXFPKMGMCCROICLCBHLCCEGLXLNLIPMNDqRT-PCRenolaseOXAMDHeNOFETGPDPPPMEAmega base pairsPGAXylitol dehydrogenasegndPGILytic polysaccharide monooxygenaseFBAXDHMNPAGLRNA-seqAGUPKIPFKLPMOAAO6-phosphogluconate dehydrogenase - 6-فسفوگلاوکونات دهیدروژنازendopolygalacturonase - EndopolygalacturonaseGlx - glxCDH - HRCPCA - PCAα-Galactosidase - α-گالاکتوزیدازβ-1,4-endoglucanase - β-1،4-اندوگلیکانازβ-1,4-glucosidase - β-1،4-گلوکوزیدازacetylesterase - آتیلسترازTAL - ازα-glucuronidase - ال-گلوکورونیدازalcohol oxidase - اکسیداز الکلaryl alcohol oxidase - اکسیداز الکل آریلIsocitrate lyase - ایزوسیترات لیائازGox - بروPrincipal component analysis - تحلیل مولفههای اصلی یا PCATransaldolase - ترانسالدولازRNA sequencing - ترتیب RNAWhite-rot - سفید پوسیدگیcellobiose dehydrogenase - سللبئوس دهیدروژنازcellobiohydrolase - سلولی بیو هیدرولازmalt extract agar - عصاره مالت آگارFructose-bisphosphate aldolase - فروکتوز بیسفسفات آلدوازFructose-2,6-bisphosphatase - فروکتوز-2،6-بیسفسفاتازFerroxidase - فرکیدیدازLar - لارLaccase - لاکاس یا لاکازlignin peroxidase - لیگنین پراکسیدازTranscriptomics - متن ترانهMan - مردpentose phosphate pathway - مسیر پنتوز فسفاتmalate dehydrogenase - ملات دهیدروژنازLignocellulose - مواد لیگنوسلولزیquantitative real-time PCR - واکنش زنجیره ای پلیمراز واقعی در زمان واقعیmanganese peroxidase - پراکسیداز منگنزVersatile peroxidase - پراکسیداز چند منظورهpolysaccharide lyase - پلی ساکارید لیائازpyruvate kinase - پیرووات کینازTCA cycle - چرخه TCAtricarboxylic acid cycle - چرخه اسید تریکاربوکیلیکcarbohydrate esterase - کربوهیدرات استرازSolid state cultivation - کشت جامدGal - گالGlucose-6-phosphate isomerase - گلوکز 6-فسفات ایزومرازglyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase - گلیسرالیدید-3-فسفات دهیدروژنازGlyoxal oxidase - گلیکسال اکسیدازglycoside hydrolase - گلیکوزید هیدرولازglycosyl transferase - گلیکوزیل ترانسفراز
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
بیولوژی سلول
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
The basidiomycete white-rot fungus Obba rivulosa, a close relative of Gelatoporia (Ceriporiopsis) subvermispora, is an efficient degrader of softwood. The dikaryotic O. rivulosa strain T241i (FBCC949) has been shown to selectively remove lignin from spruce wood prior to depolymerization of plant cell wall polysaccharides, thus possessing potential in biotechnological applications such as pretreatment of wood in pulp and paper industry. In this work, we studied the time-course of the conversion of spruce by the genome-sequenced monokaryotic O. rivulosa strain 3A-2, which is derived from the dikaryon T241i, to get insight into transcriptome level changes during prolonged solid state cultivation. During 8-week cultivation, O. rivulosa expressed a constitutive set of genes encoding putative plant cell wall degrading enzymes. High level of expression of the genes targeted towards all plant cell wall polymers was detected at 2-week time point, after which majority of the genes showed reduced expression. This implicated non-selective degradation of lignin by the O. rivulosa monokaryon and suggests high variation between mono- and dikaryotic strains of the white-rot fungi with respect to their abilities to convert plant cell wall polymers.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Fungal Genetics and Biology - Volume 112, March 2018, Pages 47-54
Journal: Fungal Genetics and Biology - Volume 112, March 2018, Pages 47-54
نویسندگان
Mila MarinoviÄ, Maria Victoria Aguilar-Pontes, Miaomiao Zhou, Otto Miettinen, Ronald P. de Vries, Miia R. Mäkelä, Kristiina Hildén,