آشنایی با موضوع

دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی (به انگلیسی: MD، Molecular Dynamics) شکلی از شبیه سازی کامپیوتری است که در ان اتمها و مولکولها اجازه دارند برای یک دوره از زمان تحت قوانین شناخته شده فیزیک باهم برهم کنش کنند و چشم اندازی از حرکت اتمها بدهند. از آنجائیکه سیستمهای مولکولی عموما شامل تعداد زیادی از ذرات هستند امکان پذیر نیست که ویژگیهای سیستمهای پیچیده را بطور تحلیلی بدست آوریم. شبیه سازی دینامیک مولکولی این مسئله را با بکار بردن روش محاسباتی حل می‌کند. این روش یک واسطه بین تجربیات آزمایشگاهی و نظریه ایجاد می‌کند و به عنوان یک آزمایش مجازی در نظر گرفته می‌شود. دینامیک مولکولی روابط بین ساختار مولکولها، حرکت مولکولهاو توابع مولکولی را بررسی می‌کند. دینامیک مولکولی یک روش منظم چندگانه‌است. قوانین و نظریه‌های آن از ریاضیات، فیزیک و شیمی بدست می‌آید و الگوریتم‌هایی را از علم رایانه و نظریه اطلاعات بکار می‌برد. دینامیک مولکولی ابتدا در فیزیک نظری در دهه ۱۹۵۰ استفاده شد. اما امروزه بیشتر در علم مواد و زیست مولکول بکار می‌رود. قبل از اینکه امکان شبیه سازی دینامیک مولکولی با رایانه‌ها بوجود بیاید عده‌ای کار سخت آزمایش کردن آن بوسیله مدلهای فیزیکی مانند کره‌های ماکروسکوپیک را متعهد شدند. ایده این بود که انها را مرتب کنند تا ویژگیهای مایع را تکرار کند. آقای برنال در سال ۱۹۶۲ گفت من تعدادی از توپهای پلاستیکی در نظر می‌گیرم و آنها را با میله‌هایی در مخدوده طول ۲٫۷۵ تا ۴ اینچ بهم می‌چسبانم و سعی می‌کنم در اولین محلی که امکانش هست در محل کارم انجام دهم و حدود هر ۵ دقیقه مختل کنم و ان کاری را که قبلا انجام داده‌ام به یاد نیاورم. اما خوشبختانه امروز رایانه‌ها مسیر قیدها را حفظ می‌کنند. دینامیک مولکولی روابط بین ساختار مولکولها، حرکت مولکولهاو توابع مولکولی را بررسی می‌کند. دینامیک مولکولی یک روش منظم چندگانه‌است. قوانین و نظریه‌های آن از ریاضیات، فیزیک و شیمی بدست می‌آید و الگوریتم‌هایی را از علم رایانه و نظریه اطلاعات بکار می‌برد. در دینامیک علتهای حرکت مورد توجه قرار می‌گیرند. یعنی هر ذره یا جسم همواره در ارتباط با محیط اطراف خود و متأثر از آنها فرض می‌شود محیط اطراف حرکت را تحت تأثیر قرار می‌دهد. به عنوان مثال فرض کنید، جسمی با جرم معین بر روی یک سطح افقی در حال لغزش است. در این مثال سطح افقی به عنوان یکی از محیطهای اطراف جسم با اعمال نیروی اصطکاک در مقابل حرکت جسم مقاومت می‌کند. دینامیک مولکولی روش شناخته شده برای شبیه سازی سیستم های پیچیده متشکل از اجزای زیاد می باشد. اساس کار دینامیک مولکولی انتگرال گیری عددی از معادلات حرکت نیوتن برای تک تک ذرات موجود در سیستم می باشد. یک نمونه شبیه سازی دینامیک مولکولی شامل ۳ مرحله زیر است: 1-. دریافت پیکربندی اولیه ذرات که عبارت است از مختصات اولیه ذرات و سرعت های آغازین و خواص فیزیکی مثل جرم و سایز و نوع ذره. 2-. محاسبه لیست همسایه ها. این لیست برای هر ذره در سیستم تشکیل می شود و شامل همه ذراتی می باشند که در برد نیروی ذره مورد نظر قرار می گیرند. به این ترتیب محاسبات از به دست آوردن اندرکنش بین یک ذره در سیستم و با کل ذرات سیستم به محاسبه اندرکنش ذره با ذراتی که در لیست همسایگی قرار می گیرند تقلیل می یابد. این لیست هرچند گام زمانی از نو ساخته می شود. 3- محاسبه نیروی وارد به هر ذره از روی پیکربندی و شرایط اولیه و محاسبه شتاب هر ذره به دست آوردن سرعت و مکان جدید هر ذره با استفاده از یکی از روش ها انتگرال گیری محاسبه مشاهده پذیرها و کمیت های مطلوب و تکرار مراحل ۱ تا ۳ به تعداد بازه های زمانی مورد نظر. بسته ها نرم افزاری متعددی برای اجرای مراحل دینامبک مولکولی وجود دارند.
در این صفحه تعداد 376 مقاله تخصصی درباره دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی که در نشریه های معتبر علمی و پایگاه ساینس دایرکت (Science Direct) منتشر شده، نمایش داده شده است. برخی از این مقالات، پیش تر به زبان فارسی ترجمه شده اند که با مراجعه به هر یک از آنها، می توانید متن کامل مقاله انگلیسی همراه با ترجمه فارسی آن را دریافت فرمایید.
در صورتی که مقاله مورد نظر شما هنوز به فارسی ترجمه نشده باشد، مترجمان با تجربه ما آمادگی دارند آن را در اسرع وقت برای شما ترجمه نمایند.
مقالات ISI دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی (ترجمه نشده)
مقالات زیر هنوز به فارسی ترجمه نشده اند.
در صورتی که به ترجمه آماده هر یک از مقالات زیر نیاز داشته باشید، می توانید سفارش دهید تا مترجمان با تجربه این مجموعه در اسرع وقت آن را برای شما ترجمه نمایند.
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; F-actin, filamentous actin; G-actin, monomeric actin; EGTA, ethylene glycol bis(β-aminoethyl ether) N,N′-tetraacetic acid; SPT, scaled particle theory; PEG, polyethylene glycol; MD, molecular dynamics; OST, osmotic stress theory; PI, preferential interact
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; CB, Cannabinoid receptor; CB1, first cannabinoid receptor; CB2, second cannabinoid receptor; GPCR, G-protein coupled receptors; MD, molecular dynamics; PME, Particle mesh Ewald; DFT, Density functional theory; 3D QSAR, three-dimensional quantitative struc
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; LTP, lipid transfer protein; OSBP, oxysterol-binding protein; ORP, OSBP-related protein; ORD, OSBP-related domain; MD, molecular dynamics; NPT, constant temperature and pressure; RMSD, root-mean-square deviationcholesterol transfer protein; lipid transfer
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; TPMT, thiopurine S-methyltransferase; SAM, S-adenosylmethionine; SAH, S-adenosylhomocysteine; MD, molecular dynamics; RMSF, root-mean-square fluctuation; B3P, 2-[3-(2-hydroxy-1,1-dihydroxymethyl-ethylamino)-propylamino]-2-hydroxymethyl-propane-1,3-diol; S
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; CF, cystic fibrosis; CFTR, cystic fibrosis transmembrane conductance regulator; ABC, ATP-binding cassette; TMD, transmembrane domain; NBD, nucleotide binding domain; PKA, protein kinase A; MoRE, molecular recognition element; MD, molecular dynamics; DMD,
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; MD, molecular dynamics; MM, molecular mechanics; RESP, restrained electrostatic potentials; SSRI, selective serotonin reuptake inhibitors; TMH, transmembrane helix; SERT, 5-HTT, serotonin transporter; 5-HT, serotonin; ICM, internal coordinate mechanics; R
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; CB, cannabinoid receptor; GPCR, G-protein-coupled receptors; TMH, transmembrane helices; EC, extracellular loop; IC, cytoplasmatic loop; R, CB1 model derived from rhodopsin; R∗, CB1 model obtained from R; MD, molecular dynamics; SA, simulated annealing; C
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; Nte, N-terminal extension; DSE, donor-strand exchange; DSC, donor-strand complementation; MD, molecular dynamics; SMD, steered molecular dynamics; BMD, biased molecular dynamicsmolecular dynamics; pili; chaperone; donor-strand exchange; assembly mechanism
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; Seladin-1, selective Alzheimer indicator-1; AD, Alzheimer disease; DHCR24, 3-β-hydoxysterol-Δ24-reductase; MD, molecular dynamics; POPC, (R)-1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine; PME, particle mesh Ewald; HMG-Coa, 3-hydroxy-3-methyl-glutaryl-C
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; MD, molecular dynamics; PrPC, cellular prion protein; PrPSc, scrapie prion protein; SSNMR, solid-state NMR; FT-IR, Fourier-transform infrared; AFM, atomic force microscopy; CSA, chemical shift anisotropy; MAS, magic-angle spinning; REDOR, rotational-echo
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; QM/MM, quantum mechanical and molecular mechanical; SwI, Switch I; SwII, Switch II; MD, molecular dynamics; PMF, potential of mean force; MEP, minimum energy path; GSBP, generalized solvent boundary potential; SCC-DFTB, self-consistent charge density func
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; MD, molecular dynamics; CD, circular dichroism; WD, Wilson disease; N-domain, ATP-binding sub-domain of Wilson disease protein (ATP7B); H1069Q, N-domain with residue 1069 changed from His to Glncopper transport; Wilson disease protein; irreversible transi
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; Aβ, amyloid β-protein; CHARMM, Chemistry at Harvard Molecular Mechanics; DB, desolvation barrier; FE-TRDG, free-energy transition disconnectivity graph; MD, molecular dynamics; SC, side chain; TRDG, transition disconnectivity graph; WT, wild typeAlzheimer
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; MD, molecular dynamics; Aβ, amyloid β; IAPP, islet amyloid polypeptide; PR, phenol red; 3D, three-dimensional; EGCG, epigallocatechin gallate; EM, electron microscopyaggregation; amyloid inhibition; molecular dynamics; pharmacophore structure; drug design
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; MAR, matrix attachment region; SAR, scaffold attachment region; EPC, 2,11-dimethyl-5-ethyl-9-hydroxy-6H-pyrido[4,3-b]carbazolium; MD, molecular dynamics; PCR, polymerase chain reaction; NOESY, nuclear Overhauser enhancement spectroscopy; NOE, nuclear Over
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; FVE, free volume elements; GCMC, grand canonical Monte Carlo; HK, Horvath-Kawazoe; MD, molecular dynamics; NVT-MD, MD simulation at constant N, V, T; NpT-MD, MD simulation at constant N, p, T; PCFF, polymer consistent force field; PIM, polymer of intrinsi
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 16 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; MM-GBSA, molecular mechanics generalized Born surface area; SIE, solvated interaction energy; MD, molecular dynamics; MM-PBSA, molecular mechanics Poisson–Boltzmann surface area; MAPK, mitogen-activated protein kinase; DB, DNA binding; AD, activation doma
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 16 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; GPCR, G-protein-coupled receptor; PSB, protonated Schiff base; meta, metarhodopsin; EII, extracellular loop II; FTIR, Fourier-transform infrared; MD, molecular dynamics; MUV, mouse UV; EE, electronic embedding; QM, quantum mechanics; MM, molecular mechani
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 16 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; LGIC, ligand-gated ion channel; PKC, protein kinase C; OBP, odorant binding protein; MD, molecular dynamics; PDB, Protein Data Bank; RMSD, root-mean-square deviation; PEG, polyethylene glycol; ANS, 1-anilino-8-naphthalenesulfonic acid; CD, circular dichro
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 17 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; GPCR, G-protein-coupled receptors; β2AR, β2-adrenergic receptor; TM, transmembrane; Meta, metarhodopsin; EPR, electron paramagnetic resonance; ICL, intracellular loop; MD, molecular dynamics; ECL2, extracellular loop 2; GTP, guanosine 5′-triphosphateGPCR;
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 17 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; PA-IL, Pseudomonas aeruginosa lectin I; Gb3, globotriaosylceramide; Ka, association constant; TLC, thin-layer chromatography; MD, molecular dynamics; BL, Burkitt lymphoma; mAb, monoclonal antibody; LacCer, lactosylceramide; iGb3, isoglobotriaosylceramide;
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 17 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; r, correlation coefficient; sd, standard deviation; rmsd, root-mean-squared deviation; S2, order parameter; S2calc, calculated order parameter; S2exp, experimental relaxation order parameter; MD, molecular dynamics; GAF, gaussian axial fluctuation; PDB, P
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 18 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; AR, ankyrin repeat; DARPins, designed AR proteins; MD, molecular dynamics; PDB, Protein Data Bank; GdnHCl, guanidine hydrochloride; CD, circular dichroism; MALS, multiangle light scatteringprotein denaturation; protein engineering; network of salt bridges
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 18 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; MD, molecular dynamics; FIRST, floppy inclusion and rigid substructure topography; 3D, three-dimensional; FRODA, framework rigidity optimized dynamics algorithm; DOF, degree(s) of freedom; dof, independent internal degree(s) of freedom; PDB, Protein Data
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 18 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; RHH, ribbon–helix–helix; ACT, aspartokinase, chorismate mutase, and TyrA; MD, molecular dynamics; PCA, principal component analysis; MSA, multiple sequence alignmentallostery; NikR; molecular dynamics; correlations; fluctuations
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 19 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; KL, key lock; CS, conformer selection; IF, induced fit; CS/IF, conformer selection/induced fit; FFT, fast Fourier transform; MC, Monte Carlo; MD, molecular dynamics; CAPRI, Critical Assessment of Protein Interactions; AChe, acetylcholinesterase; FAS2, fas
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 20 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; EF-Tu, elongation factor Tu; aa-tRNA, aminoacyl transfer RNA; GTP, guanosine 5′-triphosphate; MD, molecular dynamics; MM–PBSA, molecular mechanics–Poisson–Boltzmann surface area; PCA, principal components analysis; GDPNP, a nonhydrolyzable GTP analogue; G
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 24 صفحه سال انتشار : 2008 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; WT, wild type; MD, molecular dynamics; cc, contact configurations; dNTP, deoxyribonucleoside triphosphate; pol β, DNA polymerase β; TS, transition stateDNA polymerase beta; Enzyme preorganization; Near attack conformers; Molecular dynamics; Site mutagenes
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; Csk, carboxyl terminal Src kinase; HSQC, heteronuclear single quantum coherence; IAM, iodoacetamide; MD, molecular dynamics; NMA, normal mode analysis; SH2, Src homology 2 domain; SH3, Src homology 3 domain; SFK, Src family kinase; Src, tyrosine kinase fr
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; ΔF508, deletion Phe-508; ABC, ATP-binding cassette; CF, cystic fibrosis; CFTR, cystic fibrosis transmembrane conductance regulator; CPX, 8-cyclopentyl-1,3-dipropylxanthine; MD, molecular dynamics; MSD1/MSD2, membrane-spanning domains 1&2; NBD1/NBD2, nucle
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; protein folding/unfolding; microscopic reversibility; nonnative interactions; protein dynamics; protein refoldingCI2, chymotrypsin inhibitor 2; MD, molecular dynamics; TS, transition state; RMSD, root-mean-square deviation; NOE, nuclear Overhauser effect
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; MD, molecular dynamics; AWT, the authentic form of the wild-type goat α-lactalbumin; RWT, the recombinant form of the wild-type goat α–lactalbumin; SASA, solvent-accessible surface areamolecular dynamics simulation; protein unfolding pathway; trajectory a
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; FTIR, Fourier transform infrared; GPCR, G protein-coupled receptor; HOOP, hydrogen-out-of-plane; MD, molecular dynamics; MI, metarhodopsin I; MII, metarhodopsin II; PDB, Protein Data Bank; QM/MM, quantum mechanics/molecular mechanics; SDPC, 1-stearoyl-2-d
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; Asp, aspartic acid; CbnB2, carnobacteriocin B2; DPPC, dipalmitoylphosphatidylcholine; e, electronic charge (1.602 × 10− 19 C); His, histidine; ImB2, carnobacteriocin B2 immunity protein; LeuA, leucocin A; Lys, lysine; MD, molecular dynamics; NMR, nuclear
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; DSRU, double spectrin repeat unit; MD, molecular dynamics; RMSF, root-mean-squared fluctuation; AFM, atomic force microscopy; CG, coarse-grainedspectrin family; erythrocyte; molecular dynamics; cytoskeleton; flexibility
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; 1FMR, one-fluid mixing rule; CR, combining rule; EOS, equations of state; LJ, Lennard–Jones; LJC, Lennard–Jones chain; M&CR, mixing and combining rules; MD, molecular dynamics; NVT, canonical ensemble; RDF, radial distribution function at the contact poin
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; BP, benzo[a]pyrene; MD, molecular dynamics; NER, nucleotide excision repair; dG, deoxyguanosine; MG, minor groove; BD, base-displaced/intercalated; MM-PBSA, molecular mechanics Poisson–Boltzmann surface area; SASA, solvent-accessible surface areaDNA repai
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; MBL, metallo-β-lactamase; MD, molecular dynamics; NIT, nitrocefin; CEF, cephalothin; CTX, cefotaxime; LOR, cefaloridine; CAZ, ceftazidime; PEN, benzylpenicillin; AMP, ampicillin; IMP, imipenem; RMSD, root mean square deviation; SD, standard deviationmetal
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; SL2, stem-loop 2; RRM, RNA recognition motif; MM, molecular mechanics; PB, Poisson-Boltzman; MD, molecular dynamics; LR, linear response; GB, generalized BornMM-PB(GB)SA; U1A; protein–RNA recognition; molecular dynamics; binding free energy
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; hnRNP, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein; MD, molecular dynamics; PABP, poly(A) binding protein; PB, Poisson–Boltzmann; PSF, polypyrimidine tract-binding protein (PTB)-associated splicing factor; RRM, RNA recognition motif; SASA, solvent-accessible
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; Pol β, DNA polymerase β; MD, molecular dynamics; LRA, linear response approximation; PDLD/S, semimacroscopic protein dipole/Langevin dipole; TS, transition state; dNTP, deoxynucleoside triphosphate; WT, wild type; FEP, free energy perturbation; vdW, van d
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 15 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; ABNR, adopted Newton–Raphson; BNM, block normal mode; c-di-GMP, cyclic diguanosine monophosphate; DCCM, dynamical cross-correlation map; DIMB, diagonalization in a mixed basis; DGC, diguanylate cyclase; GTP, guanosine triphosphate; MD, molecular dynamics;
دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 16 صفحه سال انتشار : 2007 سفارش ترجمه