آشنایی با موضوع

دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی (به انگلیسی: MD، Molecular Dynamics) شکلی از شبیه سازی کامپیوتری است که در ان اتمها و مولکولها اجازه دارند برای یک دوره از زمان تحت قوانین شناخته شده فیزیک باهم برهم کنش کنند و چشم اندازی از حرکت اتمها بدهند. از آنجائیکه سیستمهای مولکولی عموما شامل تعداد زیادی از ذرات هستند امکان پذیر نیست که ویژگیهای سیستمهای پیچیده را بطور تحلیلی بدست آوریم. شبیه سازی دینامیک مولکولی این مسئله را با بکار بردن روش محاسباتی حل می‌کند. این روش یک واسطه بین تجربیات آزمایشگاهی و نظریه ایجاد می‌کند و به عنوان یک آزمایش مجازی در نظر گرفته می‌شود. دینامیک مولکولی روابط بین ساختار مولکولها، حرکت مولکولهاو توابع مولکولی را بررسی می‌کند. دینامیک مولکولی یک روش منظم چندگانه‌است. قوانین و نظریه‌های آن از ریاضیات، فیزیک و شیمی بدست می‌آید و الگوریتم‌هایی را از علم رایانه و نظریه اطلاعات بکار می‌برد. دینامیک مولکولی ابتدا در فیزیک نظری در دهه ۱۹۵۰ استفاده شد. اما امروزه بیشتر در علم مواد و زیست مولکول بکار می‌رود. قبل از اینکه امکان شبیه سازی دینامیک مولکولی با رایانه‌ها بوجود بیاید عده‌ای کار سخت آزمایش کردن آن بوسیله مدلهای فیزیکی مانند کره‌های ماکروسکوپیک را متعهد شدند. ایده این بود که انها را مرتب کنند تا ویژگیهای مایع را تکرار کند. آقای برنال در سال ۱۹۶۲ گفت من تعدادی از توپهای پلاستیکی در نظر می‌گیرم و آنها را با میله‌هایی در مخدوده طول ۲٫۷۵ تا ۴ اینچ بهم می‌چسبانم و سعی می‌کنم در اولین محلی که امکانش هست در محل کارم انجام دهم و حدود هر ۵ دقیقه مختل کنم و ان کاری را که قبلا انجام داده‌ام به یاد نیاورم. اما خوشبختانه امروز رایانه‌ها مسیر قیدها را حفظ می‌کنند. دینامیک مولکولی روابط بین ساختار مولکولها، حرکت مولکولهاو توابع مولکولی را بررسی می‌کند. دینامیک مولکولی یک روش منظم چندگانه‌است. قوانین و نظریه‌های آن از ریاضیات، فیزیک و شیمی بدست می‌آید و الگوریتم‌هایی را از علم رایانه و نظریه اطلاعات بکار می‌برد. در دینامیک علتهای حرکت مورد توجه قرار می‌گیرند. یعنی هر ذره یا جسم همواره در ارتباط با محیط اطراف خود و متأثر از آنها فرض می‌شود محیط اطراف حرکت را تحت تأثیر قرار می‌دهد. به عنوان مثال فرض کنید، جسمی با جرم معین بر روی یک سطح افقی در حال لغزش است. در این مثال سطح افقی به عنوان یکی از محیطهای اطراف جسم با اعمال نیروی اصطکاک در مقابل حرکت جسم مقاومت می‌کند. دینامیک مولکولی روش شناخته شده برای شبیه سازی سیستم های پیچیده متشکل از اجزای زیاد می باشد. اساس کار دینامیک مولکولی انتگرال گیری عددی از معادلات حرکت نیوتن برای تک تک ذرات موجود در سیستم می باشد. یک نمونه شبیه سازی دینامیک مولکولی شامل ۳ مرحله زیر است: 1-. دریافت پیکربندی اولیه ذرات که عبارت است از مختصات اولیه ذرات و سرعت های آغازین و خواص فیزیکی مثل جرم و سایز و نوع ذره. 2-. محاسبه لیست همسایه ها. این لیست برای هر ذره در سیستم تشکیل می شود و شامل همه ذراتی می باشند که در برد نیروی ذره مورد نظر قرار می گیرند. به این ترتیب محاسبات از به دست آوردن اندرکنش بین یک ذره در سیستم و با کل ذرات سیستم به محاسبه اندرکنش ذره با ذراتی که در لیست همسایگی قرار می گیرند تقلیل می یابد. این لیست هرچند گام زمانی از نو ساخته می شود. 3- محاسبه نیروی وارد به هر ذره از روی پیکربندی و شرایط اولیه و محاسبه شتاب هر ذره به دست آوردن سرعت و مکان جدید هر ذره با استفاده از یکی از روش ها انتگرال گیری محاسبه مشاهده پذیرها و کمیت های مطلوب و تکرار مراحل ۱ تا ۳ به تعداد بازه های زمانی مورد نظر. بسته ها نرم افزاری متعددی برای اجرای مراحل دینامبک مولکولی وجود دارند.
در این صفحه تعداد 376 مقاله تخصصی درباره دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی که در نشریه های معتبر علمی و پایگاه ساینس دایرکت (Science Direct) منتشر شده، نمایش داده شده است. برخی از این مقالات، پیش تر به زبان فارسی ترجمه شده اند که با مراجعه به هر یک از آنها، می توانید متن کامل مقاله انگلیسی همراه با ترجمه فارسی آن را دریافت فرمایید.
در صورتی که مقاله مورد نظر شما هنوز به فارسی ترجمه نشده باشد، مترجمان با تجربه ما آمادگی دارند آن را در اسرع وقت برای شما ترجمه نمایند.
مقالات ISI دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی (ترجمه نشده)
مقالات زیر هنوز به فارسی ترجمه نشده اند.
در صورتی که به ترجمه آماده هر یک از مقالات زیر نیاز داشته باشید، می توانید سفارش دهید تا مترجمان با تجربه این مجموعه در اسرع وقت آن را برای شما ترجمه نمایند.
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; APC, antigen presenting cell; MHC, major histocompatibility complex; pMHC, peptide/major histocompatibility complex; TCR, T cell receptor; AA, amino acid; PFR, peptide flanking region; MD, Molecular Dynamics; HB, hydrogen bond; HLA, human leukocyte antige
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; CCP, cubic close packed; DOS, density of states; FCC, face centered cubic; HTS, hydrothermal synthesis; IR/RF, infrared and radio frequency; MD, Molecular Dynamics; NVT, canonical ensemble; RESS, rapid expansion of supercritical solutions; RF, reaction fi
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; Fibrin; GBSA; SPR (surface plasmon resonance)GBSA, generalized born surface area; SPR, surface plasmon resonance; MM, molecular mechanics; MD, molecular dynamics; SASA, solvent-accessible surface area
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; MAS, magic angle spinning; NMR, nuclear magnetic resonance; MD, molecular dynamics; 31P/NMR, phosphorous NMR; CPMAS, cross polarization magic angle spinning; Na2ATP, disodium adenosine 5,5′-triphosphateSolid state NMR; MQMAS; gaussian; EFG electric field
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; CD, circular dichroism; DAUDA, 11-(dansylamino) undecanoic acid; FABP, fatty acid binding protein; F. hepatica, Fasciola hepatica; MD, molecular dynamics; MPL, monophosphoryl lipid A; PBS, phosphate-buffered saline; Rg, radius of gyration; RMSD, root mean
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; LLL, trilinoleoylglycerols; MD, molecular dynamics; MSD, mean square displacement; PC, phosphatidylcholine; PL, phospholipid; PS, phosphatidylserine; POPC, palmitoyloleoylphosphatidylcholine; RDF, radial distribution function; TG, triglyceride; TPN, total
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; aaRS, aminoacyl-tRNA synthetase; LeuRS, leucyl-tRNA synthetase; ValRS, valyl-tRNA synthetase; ThrRS, threonyl-tRNA synthetase; MD, molecular dynamics; QM/MM, quantum mechanics/molecular mechanics; ES complex, enzyme • substrate complexError-editing reacti
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; MD, molecular dynamics; FtsZEC, Escherichia coli FtsZ; FtsZMJ, Methanococcus jannaschii FtsZFtsZ; molecular dynamics; GTPase; polymerization; monovalent cations
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; GABA, γ-aminobutyric acid; TPMPA, methyl-(1,2,3,6-tetrahydropyridin-4-yl)phosphinic acid; LGIC, ligand-gated ion channel; MD, molecular dynamics; nAChR, nicotinic acetylcholine receptor; 5HT3R, 5-HT3 receptor; AChBP, acetylcholine-binding protein; LBD, li
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; Htt, Huntingtin; N17Htt, N-terminal 17 residues in the first exon of the Htt protein; ST, simulated tempering; MD, molecular dynamics; PEDF, potential energy distribution function; LR, Lifson–RoigFolding@Home; Huntington's Disease; N17Htt; Molecular Dynam
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; hCB1, human CB1 cannabinoid receptor; GPCR, G-protein-coupled receptor; HEPES, N-[2-hydroxyethylpiperazine-N′-2-ethane]sulfonic acid; TFE, trifluoroethanol; MD, molecular dynamics; SUV, small unilamellar vesicle; SPC, simple point charge; POPC, 1-palmitoy
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; PDB, Protein Data Bank; MD, molecular dynamics; POPC, 1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine; smf, sodium-motive force; pmf, proton-motive forceF1Fo-ATP synthase rotor; c-ring structure; ion coordination and selectivity; sodium-motive force; Ily
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; Aβ, amyloid β-protein; CTF, C-terminal fragment; AD, Alzheimer's disease; REMD, replica exchange molecular dynamics; IM-MS, ion mobility mass spectrometry; ATD, arrival time distribution; MD, molecular dynamics; nano-ESI, nano-electrospray ionization; MAL
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; CD, circular dichroism; CP, cross polarization; DMPC, 1,2-dimyristoyl-sn-glycero-3-phosphatidylcholine; GABA, γ-amino butyric acid; MAS, magic angle spinning; MD, molecular dynamics; MLVs, multilamellar vesicles; NMR, nuclear magnetic resonance; PISA, pol
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; AZ, azelaoyl; DLPC, dilinoleoyl phosphatidylcholine; HazPC, 1-hexadecyl-2-azelaoyl-sn-glycero-3-phosphocholine; LDL, low-density lipoprotein; MD, molecular dynamics; OX, oxo-nonanoyl; OXPLs, oxidized phospholipids; PazePC, 1-palmitoyl-2-azelaoyl-ns-glycer
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; PRE, paramagnetic relaxation enhancement; RDC, residual dipolar coupling; NOE, nuclear Overhauser effect; MD, molecular dynamics; REX-MD, replica exchange molecular dynamicsdisordered protein states; ensemble simulation; intrinsic disorder; molecular dyna
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; DPC, dodecylphosphocholine; CD, circular dichroism; NMR, nuclear magnetic resonance; MD, molecular dynamics; AMPs, antimicrobial peptides; MRSA, methicillin resistant Staphylococcus aureus; VRE, vancomycin resistant enterococci; POPC, palmitoyl-oleoyl-pho
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; PPP, pentose phosphate pathway; Tb, Trypanosoma brucei; 6PGL, 6-phosphogluconolactonase; 6PGA, 6-phosphogluconic acid; PDB, protein data bank; MD, molecular dynamics; AGP, 2-deoxy-2-amino glucitol 6-phosphate; F6R, fructose 6-phosphate6-phosphogluconolact
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; ER, endoplasmic reticulum; OST, oligosaccharyl transfer complex; CDG, congenital disorders of glycosylation; MD, molecular dynamics; NOESY, nuclear Overhauser effect spectroscopy; ROE, rotating frame nuclear Overhauser effect; RDC, residual dipolar coupli
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; MC, Monte Carlo; MD, molecular dynamics; LJ, Lennard–Jones; SB, salt bridge; HB, hydrogen bond; IS, implicit solvent; SASA, solvent-accessible surface area; CaM, calmodulin; PYP, photoactive yellow protein; WL, Wang–Landauside-chain entropy; configuration
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; CstF, cleavage stimulation factor; CPSF, cleavage and polyadenylation specificity factor; HSF, heat shock factor; SAD, single-wavelength anomalous diffraction; MD, molecular dynamics; ARM, armadillo; NLS, nuclear localization signal; MBP, maltose-binding
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; CYP-1-CO, carbon monoxide and camphor-bound oxidized cytochrome P450cam; CYP101, cytochrome P450cam; HSQC, heteronuclear single quantum correlation; CYP-1-O2, dioxygen- and camphor-bound reduced cytochrome P450cam; MD, molecular dynamics; Pdxr, reduced pu
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; EM, electron microscopy; MD, molecular dynamics; 2D, two-dimensionalelectron microscopy; proton transport; membrane protein structure; sodium–proton antiporter; membrane transport
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; TBDT, TonB-dependent transporter; OM, outer membrane; CM, cytoplasmic membrane; Cbl, cobalamin; CN-Cbl, cyanocobalamin; MD, molecular dynamics; RMSF, root-mean-square fluctuation; SB-1, substrate binding loop 1; DMPE, dimyristoyl phosphatidylethanolamine;
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; RT, reverse transcriptase; NRTI, nucleoside RT inhibitor; NNRTI, non-nucleoside RT inhibitor; MD, molecular dynamics; NNIBP, NNRTI binding pocket; HIV, human immunodeficiency virus; RNH, RNase H; APO1, apo RT with the nucleic acid binding cleft closed; AP
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; BP, benzo[a]pyrene; (+)-anti-BPDE (benzo[a]pyrene diol epoxide), (+)-(7R,8S,9S,10R)-7,8-dihydroxy-9,10-epoxy-7,8,9,10-tetrahydrobenzo[a]pyrene; dG, 2′-deoxyguanosine; NER, nucleotide excision repair; MD, molecular dynamics; NOE, nuclear Overhauser enhance
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; PIP, plasma membrane intrinsic protein; MD, molecular dynamics; TM, transmembrane; PDB, Protein Data Bank; OG, β-octyl glucoside; PEG, polyethylene glycol; ESRF, European Synchrotron Radiation Facility; PME, particle mesh EwaldX-ray crystallography; membr
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; HIV, human immunodeficiency virus; MPER, membrane-proximal external region; nAb, neutralizing antibody; HRV14, human rhinovirus type 14; AGBNP, analytical generalized Born plus nonpolar; REMD, replica exchange molecular dynamics; MD, molecular dynamics; S
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; Penetratin; Cationic peptides; Cryptococcosis; Candida infections; Molecular dynamics; Conformational analysisAIDS, acquired immunodeficiency syndrome; CPP, cell-penetrating peptide; SA, simulated annealing; MD, molecular dynamics; MIC, minimum inhibitory
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; 1D, one-dimensional; AdK, adenylate kinase; AKeco, Escherichia coli adenylate kinase; CORE, core domain of AdK; DIMS, dynamic importance sampling; FRET, Förster resonance energy transfer; LID, lid (ATP-binding) domain of AdK; MD, molecular dynamics; NMP,
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; H69, helix–loop 69; h44, helix 44; IF, initiation factor; WT, wild type; MD, molecular dynamics; GTP, guanosine triphosphateribosome; intersubunit bridge B2a; initiation; helix 69 of 23S rRNA; translational processivity
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; CC loop, C-terminal cap domain loop (α7/α8 loop); CL, chloride anion; DCL, 2,3-dichloropropane-1-ol; TCP, 1,2,3-trichloropropane; MD, molecular dynamics; NC loop, N-terminal cap domain loop (β6/α4 loop); RAMD, random acceleration molecular dynamics; PDB,
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; PCA, principal components analysis; FBP28, Formin-binding protein 28; MD, molecular dynamics; UNRES, united residue; PC, principal component; MSD, mean-square displacement; pdf, probability density functionprincipal component analysis; 1E0L; UNRES force f
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; SMUG1, single-strand-selective monofunctional uracil DNA glycosylase; UDG, uracil DNA glycosylase; XDG, xanthine DNA glycosylase; MD, molecular dynamics; TDG, thymine DNA glycosylase; MUG, mismatch-specific uracil DNA glycosylase; hAAG, human alkyladenine
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; MD, molecular dynamics; PME, Particle-Mesh Evald; RF, Reaction Field; PC, phosphatidylcholine; DPPC, dipalmitoylphosphatidylcholine; SDPC, stearoyldocosahexaenoylglycerophosphocholine; POPC, palmitoyloleoylphosphatidylcholine; POPG, palmitoyloleoylphospha
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; HA, hemagglutinin; MD, molecular dynamics; MM-GBSA, molecular mechanics-generalized Born surface area; NA, neuraminidase; RBD, receptor binding domain; SSE, secondary structure element; vdW, van der Waalsavian influenza; hemagglutinin; glycan topology; bi
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; BF2, buforin II; MD, molecular dynamics; FID, fluorescent intercalator displacement; MM-GBSA, molecular mechanics-Generalized Born surface areaHistone-derived antimicrobial peptide; Buforin II; Parasin; Hipposin; Peptide–DNA interaction; Molecular dynamic
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; OOHL, N-3-oxo-octanoyl-l-homoserine lactone; PAS-domain, Per-Arnt-Sim domain; HTH-motif, helix-turn-helix motif; MD, molecular dynamics; RMSF, root mean square fluctuationSignal transduction pathway; Molecular Dynamics; PAS-domain
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; MD, molecular dynamics; pS/pT-P motif, phospho-Serine/Threonine-Proline motifs; PPIase, petidyl-prolyl cis–trans-isomerase; p patch, phosphate binding patch; Pin1 WW domain, the WW domain of Pin1; XP groove, Xxx-Pro binding groove; PinA WW domain, the WW
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; NOX, NADH oxidase; MD, molecular dynamics; KM,NADH and KM,FMN, Michaelis–Menten constant for NADH and FMN, respectively; KSV, Stern–Volmer constant, Ttrs transition temperatureHofmeister effect; NADH oxidase; Gating mechanism; Active site; Fluorescence qu
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; CD, Circular dichroism; Chl, chlorophyll; DM, n-dodecyl-β,d-maltoside; LD, linear dichroism; LHCIIb, the major Chl a/b complexes of photosystem II; Lut, lutein; MD, molecular dynamics; Neo, neoxanthin; OG, n-octyl-β,d-glucopyranoside; PAGE, Partially dena
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; polyQ, polyglutamine; MD, molecular dynamics; MOE, Molecular Operating Environment; PBC, periodic boundary condition; RMSD, root mean square deviationPolyglutamine; Huntington's disease; Protein aggregation; β-Helix; Molecular dynamics
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; AR-JP, autosomal recessive juvenile Parkinsonism; esd, estimated standard deviation; DLM, dynamic light scattering; MD, molecular dynamics; PD, Parkinson's disease; rmsd, root-mean-square deviation; SAD, single-wavelength anomalous diffusion; Uld, ubiquit
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; MD, molecular dynamics; TTET, triplet–triplet energy transfer; SASA, solvent-accessible surface area; ORI, only repulsive interactions; DBO, 2,3-diazabicyclo[2.2.2]oct-2-ene; EEF1, effective energy function 1; ACE, analytical continuum electrostatics; GBS
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; APE, AP-endonuclease; AP site, apurinic/apyrimidinic site; BER, base excision repair; Ref-1, redox factor 1; hAPE1, human APE1; WT, wild type; MD, molecular dynamics; THF, tetrahydrofuran; EDTA, ethylenediaminetetraacetic acidhuman APE1; Ref-1; AP-endonuc
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: دینامیک مولکولی یا پویایی مولکولی; IS, immunological synapse; MD, molecular dynamics; TCR, T-cell receptor; MHC, major histocompatibility complex; pMHC, peptide-major histocompatibility complex; pMHCII, peptide-major histocompatibility complex class II; APC, antigen-presenting cell; PDB, p