آشنایی با موضوع

در ژنتیک مولکولی، یک قالب خواندن باز(ORF) یک توالی از [DNA] است که حاوی کدون خاتمه در قالب داده شده نمی‌باشد هنگام خواندن رمزها ازDNA این ابهام وجود دارد که موقعیت دقیق رمزهای آن کجاست. عبارتی که در زمینه شناسایی ژن خیلی کاربرد دارد، چارچوب قرائت باز ایست. در حقیقت چارچوب قرائت باز شامل توالی هایی از DNA است که حد اقل 100 رمز طول دارند و بین یک رمز شروع و یک رمز خاتمه قرار داشته باشند. رمز شروع در پروکاریوتها اغلب ATG خواهد بود، که اسید آمینه متیونین را رمز می کند( رمزهای ممکنه دیگرTTG،CTG ) و رمزهای پایانی شامل TGA،TAA هستند. برای هر توالی دو رشته ای DNA حداکثر شش ORF(یعنی سه تا در هر جهت )وجود دارد. باید متذکر شد که استفاده از ORF ها در جدا سازی ژنهای یوکاریوتی به دلیل وجود اینترونها و اگزونها در کنار همدیگر خطاهای فراوانی را به وجود می آورد. در حقیقت ژنهای پروکاریوتی دارای چارچوب های قرائت باز به صورت پیوسته هستند که اغلب مجاور همدیگر قرار دارند. در حالیکه ژنهای یوکاریوت به وسیله DNA بین ژنی طویل جدا شده اند و توالی های رمز کننده آنها (اگزون ها ) به وسیله اینترونهای طویل غیر رمز کننده قطع شده اند. تنظیم بیان ژن و عناصر کنترلی ژنوم های موجودات مختلف دارای ژنهای بسیار زیادی هستند که فرآورده برخی از آنها در زمانهای خاص مورد نیاز است. در حالی که فرآورده ی برخی دیگر از ژنها که به ژنهای خانه دار معروف می باشند، در همه ی دوران فعالیت سلول موجود زنده مورد نیاز هستند. برای کنترل فعالیت این ژنها عناصر کنترل کننده و عوامل رونویسی نقش دارند. عناصر کنترلی توالی های DNA در بالا دست و یا پایین دست ژن های مورد نظر هستند، که با عوامل رونویسی اثر متقابل داشته و در اتصال و هدایت RNA پلیمراز برای رونویسی از ژن های مورد نظر نقش دارند. در پروکاریوتها در پاسخ به یک سیگنال خاص، معمولا چندین ژن رمز کننده پروتئین ها به طور هماهنگ بیان می شوند. به این ساختار و عناصر کنترلی آن اپران گفته می شود و RNA که از این اپران نسخه برداری می شود ( چون دارای ژنهای کد کننده پروتئین های متفاوت است ) پلی سیسترونی می گویند. در حالی که در یوکاریوتها ساختارهای اپرانی وجود ندارد. مدلی که برای بیان این ژن ها ی یوکاریوتی توسط بترین و دیوید سون ارائه گردید، به این صورت است که عناصر کنترلی مختلف در بالا دست ژنهای متفاوت ( در نزدیک و یا داخل راه انداز ) با ترکیبی از عوامل رونویسی رمز شده، اثر متقابل داشته و این اثر متقابل منجر به بیان ژن های پایین دست می شود اهمیت یکی از کاربردهای قالب‌های خواندن باز، پیش بینی ژن است. غالباً از ORFهای طولانی، در کنار سایر شواهد استفاده می‌شود تا نواحی کدکنندهٔ پروتئین را در یک توالی DNA به طور اولیه و ابتدایی تعیین کنند. حضور یک کدون خاتمه(CRF) لزوماً به این معنی نیست که اصلاً ترجمه نمی‌شود. به عنوان مثال در یک توالی تصادفیِ DNA که درصد هر یک از نوکلئوتید‌ها در آن یکسان است، انتظار می‌رود که هر 21 کدون یکبار یک کدون خاتمه وجود داشته باشد. یک الگوریتم ساده تر پیش بینی ژن برای پروکاریوت‌ها ممکن است به دنبال کدون آغازینی بگردد که به دنبال یک قالب خواندن باز آمده باشد و این قالب به اندازهٔ کافی طولانی باشد که بتواند یک پروتئین عادی را رمز کند. یک قالب خواندن باز به تنهایی نمی‌تواند حضور ژن را نتیجه دهد. مثال اگر توالی پروتئین یک ژنوم بدست آمد (برای مثال، 5'-ATCTAAAATGGGTGCC-3')، با بررسی تمام سه حالت ممکن برای قالب‌های خواندن، قالب‌های خواندن باز شناسایی شوند. در این مثال دو تا از قالب‌های خواندن باز هستند، به این معنی که داری کدون خاتمه نیستند: . . . A TCT AAA ATG GGT GCC. . . . . . AT CTA AAA TGG GTG CC. . . . . . ATC TAA AAT GGG TGC C. . . کدون‌های خاتمهٔ ممکن "TGA"، "TAA" و "TAG" هستند. بنابراین بر خلاف دو قالب خواندن قبلی، آخرین قالب خواندن در این مثال شامل کدون خاتمهٔ (TAA) می‌باشد.
در این صفحه تعداد 1774 مقاله تخصصی درباره قالب خواندن باز که در نشریه های معتبر علمی و پایگاه ساینس دایرکت (Science Direct) منتشر شده، نمایش داده شده است. برخی از این مقالات، پیش تر به زبان فارسی ترجمه شده اند که با مراجعه به هر یک از آنها، می توانید متن کامل مقاله انگلیسی همراه با ترجمه فارسی آن را دریافت فرمایید.
در صورتی که مقاله مورد نظر شما هنوز به فارسی ترجمه نشده باشد، مترجمان با تجربه ما آمادگی دارند آن را در اسرع وقت برای شما ترجمه نمایند.
مقالات ISI قالب خواندن باز (ترجمه نشده)
مقالات زیر هنوز به فارسی ترجمه نشده اند.
در صورتی که به ترجمه آماده هر یک از مقالات زیر نیاز داشته باشید، می توانید سفارش دهید تا مترجمان با تجربه این مجموعه در اسرع وقت آن را برای شما ترجمه نمایند.
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: قالب خواندن باز; Ara-c, cytosine β-arabinofuranoside; ASFV, African swine fever virus; β-gal, β-galactosidase; EGFP, enhanced green fluorescent protein; ORF, open reading frame; MOI, multiplicity of infection; MW, molecular weight; wb, western blotAfrican swine fever viru
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: قالب خواندن باز; aa, amino acids; Ag, antigen; bp, base pairs; BLAST, basic local alignment search tool; HBV, Human Hepatitis B Virus; HCC, hepatocellular carcinoma; kbp, kilobase pairs; kDa, kilodaltons; nt, nucleotide; ORF, open reading frame; PCR, polymerase chain reac
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: قالب خواندن باز; fibrillarin; ribosomal RNA; methylation; modification-guide RNA; protistRNP, ribonucleoprotein; snoRNA, small nucleolar RNA; snRNA, small nuclear RNA; ORF, open reading frame; RACE, rapid amplification of cDNA ends; LSU, large subunit; SSU, small subunit
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: قالب خواندن باز; COG, clusters of orthologous groups; FDR, the false discovery rate; Hsp20, heat shock protein 20; Lrp, leucine-responsive regulatory protein; NNPP, Neural Network Promoter Prediction; ORF, open reading frame; RpoD, RNA polymerase sigma factor (σ70); RpoS,
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: قالب خواندن باز; ALDH, aldehyde dehydrogenase; ATQ, antiquitin; DMEM, Dulbecco’s modified Eagle’s medium; GABA, γ-aminobutyric acid; GFP, green fluorescent protein; IPTG, thio-β-d-galactoside; ORF, open reading frame; RT-PCR, reverse transcription-polymerase chain reactio
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: قالب خواندن باز; eIF, eukaryotic initiation factor; TOR, target of rapamycin; ORF, open reading frame; GAAC, general amino acid control; 4E-BP, eIF4E-binding protein; GST, glutathione-S-transferase; 3AT, 3-aminotriazole; eIF2α[pS51], eIF2α phosphorylated at Ser-51; SC-Ura
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: قالب خواندن باز; ORF, open reading frame; RACE, random amplification of cDNA ends; Ab, polyclonal antiserum; mAb, monoclonal antiserum; IPTG, isopropyl-l-thio-D-galactopyranoside; EGTA, ethylene glycol-bis(2-aminoethylether)-N,N,N′,N′-tetraacetic acid; SDS–PAGE, sodium do
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: قالب خواندن باز; ORF, open reading frame; LGR, leucine-rich repeats containing G protein-coupled receptor; CTCK, C-terminal cystine knot; WGS, whole-genome sequencing; Bursα, bursicon α subunit; Bursβ, bursicon β subunitBursicon; G protein-coupled receptor; Leucine-rich r
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: قالب خواندن باز; cDNA, complementary DNA; OAS, oral allergy syndrome; ORF, open reading frame; IPTG, isopropyl-β-thiogalactopyranoside; HSA, human serum albumin; LTP, lipid transfer protein; ntvln, villin-related protein from Nicotiana tabacumAllergy; IgE; Diagnosis; Vill
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: قالب خواندن باز; LRRC4, leucine rich repeat containing 4; LRR, leucine rich repeat; LOH, loss of heterozygosity; ESTs, expressed sequence tags; CDKI, cyclin-dependent kinase inhibitor; CDK, cyclin-dependent kinase; Tet, tetracycline; ORF, open reading frame; Dox, doxycycl