دانلود مقالات ISI درباره بانک داده پروتئین + ترجمه فارسی

بانک داده پروتئین (به انگلیسی: Protein Data Bank) (به اختصار PDB) منبعی برای داده‌های ساختار سه‌بعدی پروتئین‌ها و اسیدهای نوکلئیک است. این داده‌ها عموماً توسط بلورنگاری پرتو-ایکس یا بیناب‌نمایی ان‌ام‌آر به دست می‌آیند و توسط زیست‌شناس‌ها یا زیست‌شیمی‌پیشه‌ها از سراسر دنیا برای دسترس عموم آن‌جا گذاشته می‌شوند. مدیریت این پایگاه داده با سازمانی به نام بانک داده جهانی پروتئین (wwPDB) هستند. در این پایگاه اطلاعات مربوط به ساختار سه بعدی ماکروملکول‌های زیستی ذخیره شده است. آرشیو PDB توسط مؤسسه بینلمللی worldwide Protein Data Bank - wwPDB اداره میشود. بانک دادهٔ جهانی پروتئین (به انگلیسی: Worldwide Protein Data Bank)، که به اختصار "wwPDB" نیز نامیده می‌شود، سازمانی است که بایگانی ساختار درشت‌مولکول‌ها را در اختیار داشته و نگهداری و روزآمد می‌کند. مأموریت آن مدیریت و نگهداری یک آرشیو بانک داده پروتئین منفرد از داده‌های ساختاری درشت‌مولکول‌هاست که به طور عمومی و آزاد در دسترس جامعهٔ جهانی باشد. سازمان دارای چهار عضو است که عبارتند از: کارگروه همکاری پژوهشی برای پایگاه دادهٔ پروئتین بیوانفورماتیک ساختاری؛ (به انگلیسی: Research Collaboratory for Structural Bioinformatics Protein Database) (RCSB PDB) بانک دادهٔ پروتئین در اروپا؛ (به انگلیسی: Protein Data Bank in Europe) (PDBe) بانک دادهٔ پروتئین ژاپن؛ (به انگلیسی: Protein Data Bank Japan) (PDBj) بانک دادهٔ رزونانس مغناطیسی زیستی؛ (به انگلیسی: Biological Magnetic Resonance Data Bank) (BMRB) سازمان در سال ۲۰۰۳ (میلادی) تأسیس شده و تأسیس‌کنندگان آن کارگروه همکاری پژوهشی برای پایگاه دادهٔ پروئتین بیوانفورماتیک ساختاری (ایالات متحدهٔ آمریکا)، بانک دادهٔ پروتئین در اروپا و بانک دادهٔ پروتئین ژاپن بوده‌اند. در سال ۲۰۰۶، بانک دادهٔ رزونانس مغناطیسی زیستی (از ایالات متحدهٔ آمریکا) به سازمان پیوست. پایگاه و تشکیلات هر یک از اعضا می‌تواند داده‌های ساختاری را پذیرفته و مورد پردازش قرار دهد. داده‌های پردازش شده به دارندهٔ بایگانی فرستاده می‌شوند. هم‌اکنون کارگروه همکاری پژوهشی برای پایگاه دادهٔ پروئتین بیوانفورماتیک ساختاری به عنوان دارندهٔ بایگانی فعالیت می‌کند. این مسئله اطمینان‌بخش از آن است که فقط یک نسخه از داده‌ها که برای همهٔ کاربران یکسان است، وجود دارد. پایگاه دادهٔ تغییریافته سپس در دسترس دیگر اعضا قرار می‌گیرد. سپس، هر یک از اعضا، پرونده‌های ساختاری نتیجه را از طریق وبگاه خود در اختیار عُموم قرار می‌دهد. اطلاعات در وبگاه سازمان تنها به صورت پیوند به وبگاه‌های اعضا قابل دسترسی است. وبگاه‌های اعضا، چیزی بیش از وبگاه آیینهٔ دارندهٔ بایگانی (کارگروه همکاری پژوهشی برای پایگاه دادهٔ پروئتین بیوانفورماتیک ساختاری) هستند؛ چرا که اعضا در وبگاه‌های خود ابزارهای متفاوتی برای تحلیل و بررسی داده‌های پایگاه داده ارائه می‌کنند. پایگاه داده مرجع پروتئین انسانی (انگلیسی: Human Protein Reference Database) (با نماد اختصاری HPRD)، یک پایگاه داده پروتئین است که از طریق اینترنت قابل دسترسی می‌باشد. بررسی اجمالی اِچ‌پی‌آردی نتیجهٔ تلاش مشترک بین‌المللی میان مؤسسه بیوانفورماتیک در بنگالورو هند و آزمایشگاه Pandey در دانشگاه جانز هاپکینز در بالتیمور، ایالات متحده آمریکا است. پایگاه داده مرجع پروتئین انسانی، نظارت و مراقبت -توسط انسان- از اطلاعات علمی مربوط به زیست‌شناسی بسیاری از پروتئین‌های انسانی را دربر می‌گیرد. در این مرکز، اطلاعات در خصوص پروتئین‌های درگیر در بیماری مشخص می‌شود. این منبع، اطلاعات مربوط به عملکردهای پروتئین انسانی از جمله تعامل پروتئین-پروتئین، پیرایش پسارونویسی، روابط آنزیم سوبسترا و مشارکت در بیماری را به تصویر می‌کشد.