دانلود مقالات ISI درباره تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک + ترجمه فارسی

تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک(به انگلیسی: phylogenetic analysis) مطالعه تاریخچه تکاملی موجودات زنده با استفاده از نمودارهای (دیاگرام های) درختی شکل جهت نشان دادن اجداد و شجرنامه ارگانیسم ها است. الگوی انشعاب (شاخه ای) درخت که نشان دهنده واگرایی تکاملی است فیلوژنی نامیده می شود. قبل از تکامل مولکولی، برای استنباط فیلوژنی داده ها از منابعی نظیر مورفولوژی (ریخت شنای Morphology)، رفتار، توزیع جغرافیایی و غیره استفاده می شد. فیلوژنتیک شاخه‌ای در علم زیست‌شناسی می‌باشد که به بررسی ارتباط تکاملی گروه‌های مختلف جاندران نظیر گونه‌ها یا جمعیت‌ها می‌پردازد، که از داده‌های توالی‌یابی مولکولی و ماتریس‌های داده‌های ریخت‌شناسی] به‌دست می‌آید. واژه فیلوژنتیک از ریشه یونانی فیل (φυλή/φῦλον) به معنی «تبار»، و ژنتیکوس (γενετικός) به معنی «مربوط به زایش» یا زایشی گرفته شده‌است. آرایه‌شناسی، طبقه‌بندی، شناسایی و نام‌گذاری جانداران بسیار از فیلوژنتیک کمک گرفته‌اند، ولی همچنان از نظر روش‌شناسی و منطقی از آن مجزا هستند. گستره فیلوژنتیک مولکولی را می توان به صورت مطالعه روابط تکاملی ژن ها و سایر ماکرومولکول های بیولوژیکی به واسطه بررسی و آنالیز جهش های نواحی مختلف توالی های انها و سپس ارائه فرضیه در مورد ارتباط تکاملی مولکول های زیستی تعریف کرد. ارتباط تکاملی میان موجودات را می توان بر اساس تشابه و همسانی توالی مولکول های آنها درک نمود. به کارگیری داده های مولکولی برای بازسازی تاریخچه تکاملی، نیازمند ارائه تعدادی فرضیه معقول و مستدل است. فرض اول این است که توالی های مولکولی مورد استفاده در ساختار فیلوژنتیکی هومولوگ هستند، یعنی یک جد منشاء مشترک دارند و طی زمان از فاصله گرفته اند. واگرایی فیلوژنتیکی با دوشاخه شدن (Bifurcating) نشان داده می شود، بدین معنی که شاخه والدین به دو شاخه دختر، انشعاب می یابد. فرضیه دیگر فیلوژنتیک این است که هر ناحیه ای در توالی به صورت مستقل تکامل می یابد و تفاوت توالی ها، اطلاعات کافی و مفیدی را جهت ساخت درخت های فیلوژنتیک آگاهی دهنده و بدون ابهام (Informative) فراهم می کند. در واقع فیلوژنی را می توان از طرق مختلف مورد مطالعه قرار داد. بررسی ها معمولا با استفاده از فسیل هایی که دارای اطلاعات ریخت شناسی اجداد گونه ی فعلی و فاصله زمانی واگرایی باشد، انجام می گیرد. اما فسیل ها محدودیت های زیادی دارند; آن ها شاید تنها برای گونه های خاصی در دسترس باشند. داده های فسیل های موجود می تواند ناقص باشد و جمع اوری آنها معمولا به علت فراوانی، محل زندگی، گستره جغرافیایی و فاکتورهای دیگر محدود می شود. تفاسیری که از ویژگی های ریخت شناسی آنها می شود به علت نقش عوامل ژنتیکی گوناگون معمولا با ابهام همراه است. از این رو، استفاده از فسیل ها جهت تعیین ارتباط فیلوژنتیکی، می تواند گمراه کننده و یا جهت گیری غیر صحیح گردد. از سوی دیگر برای میکرواورکانیسم ها میکروبی فسیلی وجود ندارد و در نتیجه مطالعه ی فیلوژنی آنها از این طریق امکان پذیر نیست. اهداف فیلوژنتیکی بیشتر آنالیزهای فیلوژنتیکی بر اساس توالی های جمع آوری شده توسط بسیاری از محققان است. همراه با افزایش سریع تعداد توالی های در دسترس، استناد کردن به منابع چاپ شده غیر ممکن است بنابراین دانشمندان باید اطلاعات خود را به صورت بانک های اطلاعاتی دیجیتالی (Databases) در آورند. این بانک ها بخشی اساسی در علم بیوانفورماتیک و فیلوژنی هستند و به عنوان انبار اطلاعات بوده و امکان جستجو قوی در آن ها وجود دارد و همچنین بین بانک ها اطلاعاتی ارتباط متقابل وجود دارد. از اینها می توان به EMBL (آزمایشگاه زیست شناسی مولکولی اروپا)، GenBank در NCBI (مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی در مریلند امریکا) وddbj (بانک داده های DNA ژاپن) که هر روز به روز رسانی می شوند به صورت ماهانه گزارش می دهند.