آشنایی با موضوع

ترانسکریپتوم (به انگلیسی: Transcriptome) مجموعه ای از مولکول های آران‌ای پیام‌رسان (mRNA) یا رونوشت هایی است که در یک سلول یا در جمعیتی از سلول‌ها بیان می شود. بر خلاف ژنوم که در تمامی سلول‌های یک موجود زنده ثابت است (به استثنای جهش یافته ها)، تحت شرایط مختلف الگوی بیان ژن‌ها تغییر خواهد کرد. به بیان دیگر، ترانسکریپتوم هر سلول تحت تاثیر ژن هایی است که به طور فعال در زمانی خاص ابراز می شوند، بعلاوه، تخریب mRNA نیز آن را تحت تاثیر قرار می دهد. به طور مثال، تنها ۳ درصد توالی‌های ژنومی انسان قابل رونویسی هستند. در مغز حدود ۱۵۰۰۰ ژن بیان می‌شوند در حالی که در سلول اپتلیال روده کمتر از ۲۰۰۰ ژن رونویسی می‌گردند. از ۸۰۰۰ ژنی که در ریشه گیاه مدل آرابیداپسیس بیان می‌شوند، ۹۰ درصد آنها در ساقه نیز قابل بیان هستند. به طور خلاصه، ترانسکریپتومیکس استفاده از منابع ژنومی به منظور مطالعات عملکردی برای شناسایی و مقایسه ژن‌های بیان شونده یک ژنوم تحت شرایط مختلف محیطی، رشدی، بافتی و تکوینی می‌باشد. تغییر توجه از ژنهای منفرد به ژنوم منجر به انواع بررسیهایی شده است که هدف آنها فهم فعالیت کل ژنوم است. این کار منجر به ابداع دو اصطلاح جدید شده است: ترانسکریپتوم که محتوای mRNA) RNA) یک سلول است و الگوی کلی بیان ژن در آن منعکس می گردد. پروتئوم که محتوای پروتئین یک سلول است و قابلیت بیوشیمیایی سلول را منعکس می کند. مطالعه ترانسکریپتوم: ترانسکریپتوم ترکیب پیچیده ای است که شامل صدها یا هزاران mRNA مختلف است که هر یک بخش متفاوتی از یک جمعیت کلی است. بنابراین برای شناسایی یک ترانسکریپتوم بایستی انواع mRNA آن و به طور ایده ال فراوانی آنها را تعیین نمود. مطالعه یک ترانسکریپتوم با بررسی توالی: مستقیم ترین راه برای شناسایی ترانسکریپتوم تبدیل mRNA آن به cDNA و سپی تعیین توالی هر کلون در کتابخانه cDNA حاصل است. مقایسه توالی های cDNA و توالی ژنوم ماهیت ژنهایی که mRNA آنها در ترانسکریپتوم وجود دارد را مشخص خواهد کرد. این فرایند امکانپذیر اما پر زحمت است، زیرا توالیهای cDNA زیادی نیازمند است تا یک تصویر نسبتا کامل از ترکیب ترانسکریپتوم بدست اید. آیا می توان راه کوتاهتری برای به دست آوردن سریع اطلاعات توالیها حیاتی پیمود؟ بررسی سریالی بیان ژن (Serial analysis of gene experession) یا SAGE یک راه حل ممکن است. SAGE به جای مطالعه cDNA کامل یک توالی کوتاه 12 جفت بازی را فراهم می کند که هر کدام نماینده یک mRNA در ترانسکریپتوم می باشد. اساس این روش همین توالیهای 12 جفت بازی است که با وجود اندازه کوچکشان برای شناسایی ژنهای رمز دهنده mRNA کافی هستند. اولین مرحله برای ایجاد توالیهای 12 جفت بازی، تثبیت mRNA درون یک ستون کروماتوگرافی با اتصال دم پلی A موجود در انتهای 3 مولکولها به ریزدانه های سلولزی است. mRNA به cDNA دو رشته ای تبدیل شده و سپس با آنزیم محدود کننده دارای جایگاه شناسایی چهار تایی مانند AluI تیمار می شود تا cDNA در جایگاههای زیادی بریده شود. قطعات محدود کننده انتهایی به ریزدانه های سلولزی متصل باقی می مانند و سایر قطعات را می توان شست و از ستون خارج نمود. حال یک اتصال دهنده کوتاه به انتهای آزاد هز cDNA متصل می گردد. این اتصال دهنده دارای جایگاه شناسایی آنزیم BsmEI است. این آنزیم یک آنزیم محدود کننده غیر طبیعی است که علاوه بر برش جایگاه شناسایی خود، در فاصله 10-14 نوکلوئوتید فرودست خود نیز برش ایجاد می کند. بنابراین تیمار با BsmEI قطعاتی با میانگین طول 12 جفت باز را از انتهای هر cDNA جدا می کند. این قطعات جمع آوری شده و به صورت سر به دم به صورت یک زنجیر به هم متصل شده و تعیین توالی می گرددو توالیهای جداگانه در زنجیر قابل شناسایی هستند، زیرا با جایگاهای BsmEI از هم جدا می شوند.
در این صفحه تعداد 1509 مقاله تخصصی درباره ترانسکریپتوم که در نشریه های معتبر علمی و پایگاه ساینس دایرکت (Science Direct) منتشر شده، نمایش داده شده است. برخی از این مقالات، پیش تر به زبان فارسی ترجمه شده اند که با مراجعه به هر یک از آنها، می توانید متن کامل مقاله انگلیسی همراه با ترجمه فارسی آن را دریافت فرمایید.
در صورتی که مقاله مورد نظر شما هنوز به فارسی ترجمه نشده باشد، مترجمان با تجربه ما آمادگی دارند آن را در اسرع وقت برای شما ترجمه نمایند.
مقالات ISI ترانسکریپتوم (ترجمه نشده)
مقالات زیر هنوز به فارسی ترجمه نشده اند.
در صورتی که به ترجمه آماده هر یک از مقالات زیر نیاز داشته باشید، می توانید سفارش دهید تا مترجمان با تجربه این مجموعه در اسرع وقت آن را برای شما ترجمه نمایند.
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: ترانسکریپتوم; High-fat; Non-alcoholic liver disease; Obesity; Scopoletin; Transcriptome; ALT; alanine aminotransferase; Apoa4; apolipoprotein A-IV; AST; aspartate aminotransferase; β-oxidation; fatty acid β-oxidation; Cdkn1a; cyclin-dependent kinase inhibitor 1A; Cid
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: ترانسکریپتوم; Parkinson's disease; Levodopa; Pramipexole; Transcriptome; Striatum; Differential transcript expression patterns6-OHDA, 6-hydroxydopamine; DA, dopamine; Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein; GAPDH, Glyceraldehyde 3-phosphate dehydr
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: ترانسکریپتوم; ChIP-seq; Chromatin; Epigenetics; Gene regulatory network; Genomics; High throughput data; Network analysis; Photoreceptor; Retina; Retinal disease; RNA-Seq; Systems biology; Transcriptome; Vision; Whole exome sequencing; Whole genome sequencing; NGS data
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: ترانسکریپتوم; piRNA; PIWI-interacting RNA; hpo; hours post-oviposition; TPM; transcripts per million; RT-qPCR; reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction; Silkworm; W chromosome; Sex determination; Transcriptome; piRNA; Dosage compensation;
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: ترانسکریپتوم; Phaseolus vulgaris; Transcription levels; Transcriptome; Suppressive subtractive hybridization; Water regimensWUE, Water-use efficiency; PS, Pinto Saltillo; BM, Bayo Madero; TB, Total Biomass; A, Photosynthetic Rate; gs, Stomatal Conductance; PRO, Yield o
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: ترانسکریپتوم; Germination thermoinhibition; Illumina paired-end sequencing; Lettuce seed; Sodium nitroprusside; Transcriptome; ABA; abscisic acid; DEG; different expression gene; GA; gibberellin; GO; Gene Ontology; KEGG; Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes Pathway
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: ترانسکریپتوم; Therapy-resistant asthma; childhood asthma; peripheral blood leukocytes; transcriptome; long noncoding RNA; CA; Controlled persistent asthma; CAGE; Cap Analysis of Gene Expression; CTRL; Healthy control subject; GLM; Generalized linear model; GO; Gene Ont
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: ترانسکریپتوم; Allergome; allergen components; allergic rhinitis; IgE; Johnson grass pollen; pollen allergy; proteome; transcriptome; AR; Allergic rhinitis; 2D; Two-dimensional; JGP; Johnson grass pollen; MS; Mass spectrometry; pI; Isoelectric point; SPT; Skin prick tes
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: ترانسکریپتوم; ABA; abscisic acid; CBF; C-repeat binding factor; Cor; cold responsive; 6-FEH; fructan 6-exohydrolase; 1-FFT; fructan:fructan 1-fructosyltransferase; Lea; late embryogenesis abundant; LT; low temperature; 6-SFT; sucrose:fructan 6-fructosyltransferase; 1-S
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: ترانسکریپتوم; Periventricular tumours; Pineal parenchymal tumours; Circumventricular organs; Laser microdissection; Transcriptome; Tumeurs périventriculaires; Tumeur du parenchyme pinéal; Organes circumventriculaires; Microdissection laser; Transcriptome;
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: ترانسکریپتوم; Glaucoma; Optic nerve head; Retina; Gene expression profiling; Transcriptome; RT-qPCR; Retinal ganglion cells; Microarray; Proteomics;
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: ترانسکریپتوم; Closed-head injury; Sleep architecture; Recovery sleep; EEG spectral analysis; Transcriptome; Cerebral cortex; Hippocampus; Plasticity genes; Clock genes; Chemokines;
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: ترانسکریپتوم; melanoma; miRNA; survival; phenotype switching; transcriptome; colon; ovary; breast; lung; liver; Ewing sarcoma; neuroblastoma; glioblastoma
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: ترانسکریپتوم; Alternative splicing; mRNA; Peripheral blood mononuclear cells; Microarray; Transcriptome; Trauma; Diagnosis; Biomarker; Antioxidant; Oxidative stress;