آشنایی با موضوع

هاپلوتیپ (haplotype) عبارت است از ترکیبی از ژن‌های هم‌ردیف (الل‌ها alleles) در مکان‌های مختلف روی کروموزوم که همراه با هم منتقل می‌شوند. یک هاپلوتیپ ممکن است شامل یک مکان، چندین مکان، یا یک کروموزوم کامل باشد که وابسته به تعداد بازآرایی ها که بین مجموعه‌ای از مکان‌ها رخ می‌دهد، است. به عبارت دیگر، هاپلوتیپ یک مجموعه از چند شکلی‌های تک نوکلئوتیدی (اسنیپ‌ها) روی یک کروموزوم از جفت کروموزومی، که به صورت آماری هم‌بسته هستند، است. به نظر می‌رسد با استفاده از این هم‌بستگی‌ها و شناسایی تعداد کمی از الل‌های یک بلوک هاپلوتیپی، می‌توان به صورت بدون ابهام همه مکان‌های چند شکلی را در آن ناحیه خاص تشخیص داد. چنین اطلاعاتی در تحقیق برای عوامل ژنتیکی بیماری‌های شایع بسیار ارزشمند هستند، و در پروژه بین المللی HapMap برای انسان‌ها مورد تحقیق قرار گرفته‌اند. ژنوتیپ یک موجود زنده ممکن است دقیقاً هاپلوتیپ آن را بیان نکند. به عنوان مثال یک موجود زنده دیپلوئیدی و دو مکان دو اللی روی یک کروموزوم مثل چند شکلی‌های تک نوکلئوتیدی (اسنیپ‌ها) را درنظر بگیرید. اولین مکان دارای الل‌های A و T با سه ژنوتیپ AA، AT و TT، و دومین مکان دارای الل‌های G و C با سه ژنوتیپ GG، GC و CC می‌باشند. بنابراین یک فرد می‌تواند ۹ ترکیب متفاوت از این الل‌ها را در این دو مکان داشته باشد. جدول زیر این ترکیب‌ها را نشان می‌دهد. برای افرادی که در یک یا دو مکان هموزیگوت هستند، هاپلوتیپ‌ها واضح اند اما وقتی فرد در هر دو مکان هتروزیگوت باشد، فاز سلول جنسی دارای ابهام است. تنها روش واضح برای رفع ابهام فاز استفاده از توالی‌یابی است. هرچند، هنگامی که فاز دارای ابهام باشد، می‌توان احتمال یک هاپلوتیپ خاص را با استفاده از نمونه‌ای از افراد تخمین زد. هنگامی که ژنوتیپ تعدادی از افراد را داریم، می‌توانیم هاپلوتیپ‌ها را با استفاده از روش‌های تحلیل هاپلوتیپ‌ها (haplotype resolution) یا مرحله‌بندی هاپلوتیپ‌ها (haplotype phasing) به دست بیاوریم. این روش‌ها با استفاده از این مشاهده که وجود هاپلوتیپ‌های خاصی در مکان‌های خاصی از ژنوم رایج است کار می‌کنند. بنابراین، هنگامی که مجموعه‌ای از تحلیل‌های متفاوت را برای هاپلوتیپ‌ها داریم، این روش‌ها آن‌هایی را انتخاب می‌کنند که در کل از هاپلوتیپ‌های متفاوت کمتری استفاده می‌کنند. مشخصه‌های این روش‌ها متفاوت است. بعضی بر پایه روش‌های ترکیبیاتی هستند (مثل پارسیمونی) در حالی که بقیه از توابع درست‌نمایی استفاده می‌کنند که بر پایه مدل‌ها و فرضیات متفاوتی می‌تواند باشد. مثل اصل Hardy-Weinberg، مدل نظریه coalescent، یا perfect phylogeny. این مدل‌ها با الگوریتم‌های بهینه سازی مثل الگوریتم ماکزیمم سازی مقدار مورد انتظار (expectation-maximization)، زنجیره مارکوف مونت کارلو (MCMC) و مدل‌های مارکوف پنهان ترکیب می‌شوند.

در این صفحه تعداد 728 مقاله تخصصی درباره هاپلوتیپ که در نشریه های معتبر علمی و پایگاه ساینس دایرکت (Science Direct) منتشر شده، نمایش داده شده است. برخی از این مقالات، پیش تر به زبان فارسی ترجمه شده اند که با مراجعه به هر یک از آنها، می توانید متن کامل مقاله انگلیسی همراه با ترجمه فارسی آن را دریافت فرمایید.
در صورتی که مقاله مورد نظر شما هنوز به فارسی ترجمه نشده باشد، مترجمان با تجربه ما آمادگی دارند آن را در اسرع وقت برای شما ترجمه نمایند.
مقالات ISI هاپلوتیپ (ترجمه نشده)
مقالات زیر هنوز به فارسی ترجمه نشده اند.
در صورتی که به ترجمه آماده هر یک از مقالات زیر نیاز داشته باشید، می توانید سفارش دهید تا مترجمان با تجربه این مجموعه در اسرع وقت آن را برای شما ترجمه نمایند.
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: هاپلوتیپ; CAT; catalase; BS; bariatric surgery; BMI; body mass index; HDL; high density lipoprotein; LDL; low density lipoprotein; CRP; C-reactive protein; SBP; systolic blood pressure; DBP; diastolic blood pressure; M12; time 12 months after surgery; M0; before
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: هاپلوتیپ; CAP; community-acquired pneumonia; IRF5; interferon regulatory factor 5; TLR; Toll-like receptor; NF-κB; nuclear factor kappa-light-chain-enhancer of activated B cells; IFNs; type I interferons; IL-6; interleukin-6; IL-12; interleukin-12; TNF-α; tumor n
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: هاپلوتیپ; BM; bone marrow; CDR; complementarity determining region; H; heavy; PB; peripheral blood; V; variable; Antibody; Antibody repertoire; Bioinformatics; Germline gene; Germline gene inference; Haplotype; Heavy chain variable domain;
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: هاپلوتیپ; ANCOVA; analysis of covariance; ALA; a-linolenic acid; AA; arachidonic acid; DGLA; dihomo-γ-linolenic acid; DTA; docosatetraenoic acid; DHA; docosahexenoic acid; df; degrees of freedom; EPA; eicosapentaenoic acid; FADS; fatty acid desaturase; LA; linolei
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: هاپلوتیپ; GWAS; genome-wide association study; SNPs; single nucleotide polymorphisms; JHS; Jackson Heart Study; BMI; body mass index; MDR; multifactor dimensionality reduction; SE; standard error; MAF; minor allele frequency; HWE; Hardy-Weinberg equilibrium; LD; li
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: هاپلوتیپ; mtDNA; mitochondrial DNA; Y-DNA; Y chromosomal DNA; Human ancestry; Mitochondrial DNA; Haplotype; Afro-Colombian; Africa; Trans-Atlantic slave voyages; Bayes' rule; Combined evidence;
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: هاپلوتیپ; Major histocompatibility complex (MHC); HLA; Haplotype; Linkage disequilibrium (LD); Graft-versus-host disease (GVHD); Hematopoietic cell transplantation (HCT); Unrelated donor; Cord blood transplantation; Single nucleotide polymorphism (SNP);
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: هاپلوتیپ; Allele; Haplotype; Inflammation; Interleukin-10; Polymorphism; Preeclampsia; BMI; Body Mass Index; CI; confidence intervals; DBP; diastolic blood pressure; DNA; deoxyribonucleic acid; EDTA; Ethylenediaminetetraacetic acid; H; hour; HELLP; hemolysis, eleva
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: هاپلوتیپ; APR; average peeling rate; DPP; difficult-peeling pellicle; EPP; easy-peeling pellicle; HOP; high-temperature oil peeling; MAS; marker-assisted selection; NARO; National Agriculture and Food Research Organization; NIFTS; Institute of Fruit Tree and Tea Sc