آشنایی با موضوع

منظور از siRNA مکانیسم خاموشی قوی و اختصاصی ژن است که توسط RNAدو رشته ای درونزاد (miRNA)یا برونزاد (siRNA)ایجاد می شود. اثرات RNAiبرای اولین بار توسط Napoliو همکارانش (در سال ۱۹۹1، به عنوان نتیجه تلاش آنها برای افزایش بیان کالکون سنتتاز (chalcone synthetase،CHS)،آنزیمی که تا حد زیادی مسئول رنگ گیاهی در گل اطلسی است، گزارش شد. برای مولکول های شکسته شده RNAدو مسیر وجود دارد: 1-RNAهای ناقص توسط ریبونوکلئازها تجزیه شوند 2-روی رشته هایی که با آنها همولوژی دارند، قرار گیرند و توسط RNAپلی مراز وابسته به RNAمجدداً دو رشته ای شده که در این صورت موجب تداوم مسیر RNAiمی شوند. SiRNA که یکی از انواع RNAi است امروزه کاربرد بسیاری پیدا کرده است. در این روش از توالی های دو رشته ای کوتاه RNA استفاده میشود. SiRNA مولکول های دو رشته ای RNA به طول 21 تا 25 نوکلئوتید هستند که توالی مکمل ژن مورد نظر را دارد و به صورت اختصاصی باعث کاهش ترجمه mRNA و تجزیه آن میشود. مکانیسم عمل این مولکول به این صورت است که مولکول dsRNA توسط یک آنزیم ریبونوکلئاز 3 به نام دایسر بریده میشود و یک توالی دو رشته ای 22 نوکلئوتیدی که در هر رشته در سمت 3 از رشته مقابل بلندتر است ایجاد میشود. این مولکول سپس به کمپلکس Risc متصل میشود این کمپلکس توسط آنزیم RNA هلیکاز مولکول SiRNA را تک رشته کرده و فقط رشته آنتی سنس داخل کمپلکس باقی می ماند. کمپلکس Risc که دارای رشته RNA آنتی سنس است به مولکول MRNA داخل سیتوپلاسم که توالی مکمل آن را داشته باشند متصل میشود. این اتصال علاوه بر جلوگیری از ترجمه باعث ایجاد یک برش در ساختار MRNA در فاصله 10 نوکلئوتید از انتهای ´5 مولکول SiRNA متصل شده میشود. این برش سبب میشود دیگر انتهای ´3 محافظت نشده و باعث ناپایداری ساختار MRNA و تجزیه آن شود و یا به صورت DNA داخل یک حامل وارد سلول شده و پس از رونویسی به صورت shRNA توسط دایسر بریده شده و به مسیر SiRNA وارد میشود. در چند سال گذشته پیشرفتهای فوق العاده ای در روش های خاموش سازی ژن براساس RNAinterference ایجاد شده و محققان از آن جهت خاموش سازی ژن بهره میبرند امروزه مشخص شده که میتوان از RNAi در زمینه های مختلفی از قبیل شناسایی مسیرهای پیام رسانی (signaling)، شناسایی عملکرد ژنها و درمان بیماری استفاده کرد. در طراحی siRNA باید معیارهای زیر رعایت گردد: 1- طول مولکول siRNA: siRNA موثر21 bp طول داشته و دارای آویزه 2 یا 3 بازی هستند 2- توالی مولکول siRNA: توصیه شده که بهتر است توالی های هدف siRNA به صورت AA (N19) TT باشد. علاوه بر این پیشنهاد شد که آویزه نیز توالی UU یا TT داشته باشد. 3- درصد GC مولکول siRNA: مطلوب است که محتوای GC مولکول حدوداً 35 تا 60 درصد باشد. 4- ناحیه مورد هدف siRNA در mRNA : ایده آل این است که در ناحیه ORF 1 باشد شناسایی بهترین توالی هدف یک پروسه امتحانی و آزمایشی است و تعدادی از siRNA باید علیه مکان های متفاوت در یک مولکول mRNA خاص آزمایش شود توصیه شده که نوکلئوتیدهای 75 تا 100 ابتدایی از هر mRNA پتانسیل لازم به عنوان مکان هدف کارآمد را ندارد زیرا نوکلئوتیدهای 75 تا 100 ابتدایی ممکن است در ناحیه UTR´5 مولکول mRNA باشند که در این شاید پروتئین های متصل شونده به mRNA حضور داشته باشند و میتوانند در عملکرد siRNA تداخل ایجاد کنند. 5- ارجحیت مکانی برای Risc: گزارش شده که ارجحیت مکانی باعث میشود که تنها یک رشته از siRNA دو رشته ای Risc شرکت یابد در این حالت ترجیحاً رشته آنتی سنس از siRNA به Risc متصل میشود معلوم شده زمانی که siRNA از لحاظ ترمودینامیکی ناپایدار باشند (غنی از ALU) یا سمت انتهای ´5 رشته آنتی سنس ناجورشدگی هایی (mismatch) وجود داشته باشد آن رشته ترجیحاً توسط Risc استفاده میشود در نتیجه بازدهی خاموش سازی افزایش میابد 6- اختصاصیت توالی هدف siRNA: جستجوی BIAST باید انجام شود تا توالی غیر اختصاصی شناسایی شوند 7- پیچیدگی توالی: از وجود سه آدنین و سه تیمین متوالی جلوگیری میشود زیرا سبب ختم زودرس رونویسی میشود. 8- نوع ارگانیسم: بستگی به اینکه موش، انسان، رت یا دروزوفیلا باشد طراحی متفاوت خواهد بود در مجموع siRNA مناسب 19 نوکلئوتید طول داشته که در سر هر ´3 خود نیز آویزه 12 اوریدینی یا دزوکسی تیمیدینی دارد از این رو توالی هدف همیشه با دو آدنین شروع میشود که مکمل با آویزه در اوریدین رشته آنتی سنس siRNA است.
در این صفحه تعداد 2716 مقاله تخصصی درباره siRNA که در نشریه های معتبر علمی و پایگاه ساینس دایرکت (Science Direct) منتشر شده، نمایش داده شده است. برخی از این مقالات، پیش تر به زبان فارسی ترجمه شده اند که با مراجعه به هر یک از آنها، می توانید متن کامل مقاله انگلیسی همراه با ترجمه فارسی آن را دریافت فرمایید.
در صورتی که مقاله مورد نظر شما هنوز به فارسی ترجمه نشده باشد، مترجمان با تجربه ما آمادگی دارند آن را در اسرع وقت برای شما ترجمه نمایند.
مقالات ISI siRNA (ترجمه نشده)
مقالات زیر هنوز به فارسی ترجمه نشده اند.
در صورتی که به ترجمه آماده هر یک از مقالات زیر نیاز داشته باشید، می توانید سفارش دهید تا مترجمان با تجربه این مجموعه در اسرع وقت آن را برای شما ترجمه نمایند.
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; CEA; carcinoembryonic antigen; CEACAM1; carcinoembryonic antigen related cell adhesion molecule 1; EMT; epithelial-mesenchymal transition; ITIMs; immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motifs; siRNA; small interfering RNA; TBST; tris buffered saline w
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; eNOS; endothelial nitric oxide synthase; EC; endothelial cell(s); NO; nitric oxide; AMPK; AMP-activated protein kinase; CaMKII; calmodulin-dependent kinase II; PKA; protein kinase A; atRA; all-trans retinoic acid; PP; protein phosphatase; PP2A Cα; cataly
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; ACN; acetonitrile; DMT; dimethoxytrityl; EMAM; ethanolic methylamine/aqueous methylamine; MALDI-TOF; matrix assisted laser desorption/ionization - time of flight; MOPS; 3-(N-morpholino)propanesulfonic acid; ON; oligonucleotide; PAGE; polyacrylamide gel
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; siRNA; small interference RNA; RNAi; RNA interference; HCC; hepatocellular carcinoma; ROS; reactive oxygen species; TIGAR; TP53-induced glycolysis and apoptosis regulator; siTIGAR; siRNA for TIGAR; TIGAR; Apoptosis; Autophagy; Hepatocellular carcinoma; RN
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; AKT; v-akt murine thymoma viral oncogene; CRC; colorectal cancer; FDR; false discovery rate; HECT; homologous to E6AP C terminus; KEGG; Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes; mut; mutated; NCBI; National Center for Biotechnology Information; PBS; phosph
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; 4α-PDD; the phorbol ester 4α-phorbol 12,13-didecanoate; cAMP; cyclic adenosine monophosphate; hIAPP; human islet amyloid polypeptide; KRHB; Krebs-Ringer-HEPES buffer; PKC; protein kinase C; siRNA; small interfering RNA; nt siRNA; non-targeting siRNA;
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; HBx; hepatitis B virus X protein; HCC; hepatocellular carcinoma; mCRPs; membrane-bound complement regulatory proteins; CDC; complement-dependent cytotoxicity; COX-2; cyclooxygenase-2; PGE2; prostaglandin E2; CREB; cAMP response element-binding protein; RN
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; HBV; hepatitis B virus; HCC; hepatocellular carcinoma; HBsAg; hepatitis B surface antigen; HBs; S region of HBsAg; CH; chronic hepatitis; ECHS1; mitochondrial short chain enoyl-CoA hydratase; MMP; mitochondrial membrane potential; AIP; arylhydrocarbon rec
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; Amphiphilic poly(allylamine); siRNA; Polymeric micelles; Nano-sized; Gastrointestinal disease; Non-viral delivery; Ch2.5; cholesteryl modified poly(allylamine); GI; gastrointestinal; MTT; 3-(4,5dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide; NP; na
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; Acadm; acyl-coenzyme A dehydrogenase medium chain; HCV; hepatitis C virus; Herc5; HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5; HnrnpA3; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3; HnrnpK; heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K; Hmgcs1;
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; ATM; atazia-telagiectasia mutated; Caspase; cystein aspartyl-specific protease; Cdc 2; cell division cycle 2; Cdk; cyclin-dependent kinase; CDKI; cyclin-dependent kinase inhibitor; ERK; extracellular signal-regulated kinase; MAPK; mitogen activated protei
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; ARE; antioxidant response element; CO; carbon monoxide; DMSO; dimethyl sulfoxide; EE-IDS; ethanol extracts of Indigofera suffruticosa Mill; EMSA; electrophoretic mobility shift assay; ERK1/2; extracellular signal-regulated kinase 1/2; FE; formononetin equ
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; NAC; N-acetylcysteine; ECM; extracellular matrix; PI3K; phosphoinositide 3-kinase; SDS; sodium dodecyl sulfate; HRP; horseradish peroxidase; ECL; enhanced chemiluminescence; siRNA; small interfering RNA; PBS; phosphate buffered saline; Akt; serine/threoni
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; HSC; hepatic stellate cell; IFN; interferon; MDSC; myeloid derived suppressor cell; PGE2; prostaglandin E2; SCF; stem cell factor; siRNA; small interfering RNA; shRNA; small hairpin RNA; VEGF; vascular endothelial growth factor; Hepatic stellate cell; Mye
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; dsRNase; double-stranded RNase; ssRNase; single-stranded RNase; miRNA; microRNA; PIP-seq; protein interaction profile sequencing; siRNA; small interfering RNA; PARS; parallel analysis of RNA structure; RNA secondary structure; RNA-binding proteins; Post-t
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; GAPDH; glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase; hASCs; human adipose tissue-derived MSCs; MSCs; mesenchymal stem cells; OSM; oncostatin M; OSM CM; conditioned medium from OSM-treated hASCs; PBS; phosphate-buffered saline; SDF-1; stromal cell-derived fact
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; CaMKK; Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase kinase; AMPK; AMP-activated protein kinase; ACC; acetyl-CoA carboxylase; ER; endoplasmic reticulum; PERK; double stranded RNA-activated protein kinase-like ER-associated kinase; IRE-1; inositol requiring ER-
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; BGMV; Bean golden mosaic virus; RNAi; interfering RNA; GM; genetically modified; TAIL-PCR; thermal asymmetric interlaced PCR; siRNA; small interfering RNA; PTGS; post-transcriptional gene silencing; NUPTs; nuclear-plastid sequences; Begomovirus; Dry bean;
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; bFGF; basic fibroblast growth factor; Cx(s); connexin(s); EdU; 5-ethynyl-2′-deoxyuridine; EGF; epidermal growth factor; EGFR; epidermal growth factor receptor; FRAP; fluorescence recovery after photobleaching; GJ(s); gap junction(s); GJIC; gap junctiona
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; AKR; aldo-keto reductases; CSF; cerebrospinal fluid; 4-HNE; 4-hydroxynonenal; RNAi; RNA interference; siRNA; small inhibitory RNA; t-BHQ; tert-butylhydroquinone; MTT; 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide; D3T; 3H-1,2-dithiole-3-t