آشنایی با موضوع

منظور از siRNA مکانیسم خاموشی قوی و اختصاصی ژن است که توسط RNAدو رشته ای درونزاد (miRNA)یا برونزاد (siRNA)ایجاد می شود. اثرات RNAiبرای اولین بار توسط Napoliو همکارانش (در سال ۱۹۹1، به عنوان نتیجه تلاش آنها برای افزایش بیان کالکون سنتتاز (chalcone synthetase،CHS)،آنزیمی که تا حد زیادی مسئول رنگ گیاهی در گل اطلسی است، گزارش شد. برای مولکول های شکسته شده RNAدو مسیر وجود دارد: 1-RNAهای ناقص توسط ریبونوکلئازها تجزیه شوند 2-روی رشته هایی که با آنها همولوژی دارند، قرار گیرند و توسط RNAپلی مراز وابسته به RNAمجدداً دو رشته ای شده که در این صورت موجب تداوم مسیر RNAiمی شوند. SiRNA که یکی از انواع RNAi است امروزه کاربرد بسیاری پیدا کرده است. در این روش از توالی های دو رشته ای کوتاه RNA استفاده میشود. SiRNA مولکول های دو رشته ای RNA به طول 21 تا 25 نوکلئوتید هستند که توالی مکمل ژن مورد نظر را دارد و به صورت اختصاصی باعث کاهش ترجمه mRNA و تجزیه آن میشود. مکانیسم عمل این مولکول به این صورت است که مولکول dsRNA توسط یک آنزیم ریبونوکلئاز 3 به نام دایسر بریده میشود و یک توالی دو رشته ای 22 نوکلئوتیدی که در هر رشته در سمت 3 از رشته مقابل بلندتر است ایجاد میشود. این مولکول سپس به کمپلکس Risc متصل میشود این کمپلکس توسط آنزیم RNA هلیکاز مولکول SiRNA را تک رشته کرده و فقط رشته آنتی سنس داخل کمپلکس باقی می ماند. کمپلکس Risc که دارای رشته RNA آنتی سنس است به مولکول MRNA داخل سیتوپلاسم که توالی مکمل آن را داشته باشند متصل میشود. این اتصال علاوه بر جلوگیری از ترجمه باعث ایجاد یک برش در ساختار MRNA در فاصله 10 نوکلئوتید از انتهای ´5 مولکول SiRNA متصل شده میشود. این برش سبب میشود دیگر انتهای ´3 محافظت نشده و باعث ناپایداری ساختار MRNA و تجزیه آن شود و یا به صورت DNA داخل یک حامل وارد سلول شده و پس از رونویسی به صورت shRNA توسط دایسر بریده شده و به مسیر SiRNA وارد میشود. در چند سال گذشته پیشرفتهای فوق العاده ای در روش های خاموش سازی ژن براساس RNAinterference ایجاد شده و محققان از آن جهت خاموش سازی ژن بهره میبرند امروزه مشخص شده که میتوان از RNAi در زمینه های مختلفی از قبیل شناسایی مسیرهای پیام رسانی (signaling)، شناسایی عملکرد ژنها و درمان بیماری استفاده کرد. در طراحی siRNA باید معیارهای زیر رعایت گردد: 1- طول مولکول siRNA: siRNA موثر21 bp طول داشته و دارای آویزه 2 یا 3 بازی هستند 2- توالی مولکول siRNA: توصیه شده که بهتر است توالی های هدف siRNA به صورت AA (N19) TT باشد. علاوه بر این پیشنهاد شد که آویزه نیز توالی UU یا TT داشته باشد. 3- درصد GC مولکول siRNA: مطلوب است که محتوای GC مولکول حدوداً 35 تا 60 درصد باشد. 4- ناحیه مورد هدف siRNA در mRNA : ایده آل این است که در ناحیه ORF 1 باشد شناسایی بهترین توالی هدف یک پروسه امتحانی و آزمایشی است و تعدادی از siRNA باید علیه مکان های متفاوت در یک مولکول mRNA خاص آزمایش شود توصیه شده که نوکلئوتیدهای 75 تا 100 ابتدایی از هر mRNA پتانسیل لازم به عنوان مکان هدف کارآمد را ندارد زیرا نوکلئوتیدهای 75 تا 100 ابتدایی ممکن است در ناحیه UTR´5 مولکول mRNA باشند که در این شاید پروتئین های متصل شونده به mRNA حضور داشته باشند و میتوانند در عملکرد siRNA تداخل ایجاد کنند. 5- ارجحیت مکانی برای Risc: گزارش شده که ارجحیت مکانی باعث میشود که تنها یک رشته از siRNA دو رشته ای Risc شرکت یابد در این حالت ترجیحاً رشته آنتی سنس از siRNA به Risc متصل میشود معلوم شده زمانی که siRNA از لحاظ ترمودینامیکی ناپایدار باشند (غنی از ALU) یا سمت انتهای ´5 رشته آنتی سنس ناجورشدگی هایی (mismatch) وجود داشته باشد آن رشته ترجیحاً توسط Risc استفاده میشود در نتیجه بازدهی خاموش سازی افزایش میابد 6- اختصاصیت توالی هدف siRNA: جستجوی BIAST باید انجام شود تا توالی غیر اختصاصی شناسایی شوند 7- پیچیدگی توالی: از وجود سه آدنین و سه تیمین متوالی جلوگیری میشود زیرا سبب ختم زودرس رونویسی میشود. 8- نوع ارگانیسم: بستگی به اینکه موش، انسان، رت یا دروزوفیلا باشد طراحی متفاوت خواهد بود در مجموع siRNA مناسب 19 نوکلئوتید طول داشته که در سر هر ´3 خود نیز آویزه 12 اوریدینی یا دزوکسی تیمیدینی دارد از این رو توالی هدف همیشه با دو آدنین شروع میشود که مکمل با آویزه در اوریدین رشته آنتی سنس siRNA است.
در این صفحه تعداد 2716 مقاله تخصصی درباره siRNA که در نشریه های معتبر علمی و پایگاه ساینس دایرکت (Science Direct) منتشر شده، نمایش داده شده است. برخی از این مقالات، پیش تر به زبان فارسی ترجمه شده اند که با مراجعه به هر یک از آنها، می توانید متن کامل مقاله انگلیسی همراه با ترجمه فارسی آن را دریافت فرمایید.
در صورتی که مقاله مورد نظر شما هنوز به فارسی ترجمه نشده باشد، مترجمان با تجربه ما آمادگی دارند آن را در اسرع وقت برای شما ترجمه نمایند.
مقالات ISI siRNA (ترجمه نشده)
مقالات زیر هنوز به فارسی ترجمه نشده اند.
در صورتی که به ترجمه آماده هر یک از مقالات زیر نیاز داشته باشید، می توانید سفارش دهید تا مترجمان با تجربه این مجموعه در اسرع وقت آن را برای شما ترجمه نمایند.
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; Apoptosis; Colon Cancer; ER Stress; UGT1A; AOM; azoxymethane; CRC; colorectal cancer; DSS; dextran sodium sulfate; ER; endoplasmic reticulum; IEC; intestinal epithelial cells; IL; interleukin; MTT; 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium brom
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; High throughput screening; Gene therapy; Hammerhead ribozyme; RNAi; siRNA; shRNA; DNAzyme; RNA drug discovery; Hereditary retinal degenerations; Autosomal dominant retinitis pigmentosa; anova; analysis of variance; bp; base pair; CV; coefficient of variat
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; qPCR; quantitative real-time PCR; SR proteins; serine/arginine-rich proteins; miRNA; microRNA; siRNA; small interfering RNA; SDS-PAGE; sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis; SRSF7; Osteopontin; SPP1; Alternative splicing; microRNA; Ren
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; Apoe; Apolipoprotein e; CTGF; Connective tissue growth factor; CNN; Calponin; DN; Dominant negative; ECM; Extracellular matrix; FBS; Foetal bovine serum; HG; High glucose; LCA; Left common carotid artery; mRNA; Messenger ribonucleic acid; MASM; Mouse Aort
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; Sleeping Beauty; Liver Cancer; RalGAPs; Kinase Inhibitor; CCG; candidate cancer genes; CIS; common transposon insertion site; gCIS; gene-centric common transposon insertion site-calling method; GTPase; guanosine triphosphatase; HBsAg; hepatitis B surfac
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; TMHM,; Taraxacum mongolicum Hand.-Mazz; OAC; organic acid component; LPS; lipopolysaccharide; IKK; inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase; GAPDH; glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase; NHBE; Normal Human Bronchial Epithelial; IF; Immunofluorescence
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; SET; Suppressor of variegation, Enhancer of Zeste, Trithorax; MYND; Myeloid-Nervy-DEAF1; siRNA; small interfering RNA; VEGFR1; vascular endothelial growth factor receptor-1; MD; molecular dynamics; HKMT; histone lysine methyltranferase; RMSD; root-mean sq
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; Netrin; UPR; Hepatocyte; Translation; ATF6; activated transcription factor 6; CMV; cytomegalovirus; DAPK; death-associated protein kinase; DMS; dimethyl sulfate; DR; dependence receptor; DTT; dithiothreitol; eIF2α; Eukaryotic translation initiation facto
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; 3-MA; 3-methyladenine; AID; autoinflammatory disorder; CRISPR; clustered regularly-interspaced short palindromic repeats; Cas9; CRISPR-associated endonuclease 9; GFP; green fluorescent protein; MALP-2; macrophage-activating lipopeptide 2; siRNA; small int
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; BTV; bluetongue virus; CHIKV; Chikungunya virus; CPE; cytopathic effect; DENV; dengue fever virus; dsRNA; double-stranded RNA; DMEM; Dulbecco's modified Eagle's medium; FBS; fetal bovine serum; GO; gene ontology; KEGG; Kyoto Encyclopedia of Genes Genomes;
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; p53; Arf; Mdm2; Akt; MAZ; Phosphorylation; ChIP; chromatin immunoprecipitation; Dox; doxycycline; EMSA; electrophoretic mobility shift assay; IB; immunoblotting; IP; immunoprecipitation; Myr-Akt; myristoylatedAkt; siRNA; small interference RNA; WB; Wester
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; B-RAFi; B-RAF inhibition; ctrl; control; CXCL10; C-X-C motif chemokine 10; DR; acquired double resistance to B-RAFi and MEKi; MEKi; mitogen-activated protein kinase/extracellular signal-regulated kinase inhibition; OH; unmodified siRNA (hydroxy terminus);
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; AP-1; activator protein-1; C/EBP-β; CCAAT-enhancer-binding protein-β; ERK; extracellular signal-regulated kinase; hBD2; human β-defensin 2; JNK; c-Jun N-terminal kinase; MAPK; mitogen-activated protein kinase; mRNA; messenger RNA; OCT1; octamer transcr
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; Pparγ; peroxisome proliferator activated receptor γ; aP2; adipocyte protein 2; siRNA; small interfering RNA; MSC; mesenchymal stem cells; DMI; Dexamethasone, IBMX, and Insulin; Dnajb1; DnaJ (Hsp40) Homolog, Subfamily B, Member 1; LCA; licochalcone A; TN
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; miR; microRNA; HDAC; histone deacetylase; OA; osteoarthritis; COL2A1; collagen 2; SOX9; SRY (sex-determining region Y)-box 9; RUNX2; Runt-related transcription factor 2; HAT; histone acetyltransferase; TSA; trichostatin A; Mmp13; matrix metalloproteinase
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; DPQ; 3,4-dihydro-5-[4-(1-piperidinyl) butoxy]-1(2H)-isoquinolinone; HMGB1; high-mobility group protein B1; LC3; light chain 3 protein; MC; normal human melanocytes; mTOR; mechanistic target of rapamycin; NER; nucleotide excision repair; PAR; poly(adenosin
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; Hypertriglyceridemia; Lipid-Sensing; Fat Absorption; Triglyceride-Rich Lipoproteins; apoB; apolipoprotein B; BBM; brush-border membrane; CM; chylomicron; DMSO; dimethyl sulfoxide; LXR; liver X receptor; mRNA; messenger RNA; PDZK1; PDZ-containing kidney pr
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; ApoE−/−; apolipoprotein E-deficient; GAPDH; glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase; HCD; high-cholesterol diet; HDL; high-density lipoprotein; HUVEC; human umbilical vein endothelial cells; ICAM-1; intracellular adhesion molecule-1; LDL; low-densi
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; LPS; lipopolysaccharide; TNFα; tumor necrosis factor-alpha; siRNA; small interfering ribonucleic acids; CNS; central nervous system; SNTF; TNFα silencing siRNA in aqueous solution; SNE; TNFα silencing siRNA-encapsulated in cationic nanoemulsion.; Neuro
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; H. pylori; Helicobacter pylori; CagA; cytotoxin associated antigen A; DAPI; 4-6-diamidino-2-phenylindole; ELISA; enzyme-linked immunosorbent assay; FACS; fluorescence activated cell sorting; FUTs; fucosyltransferases; FUT4; fucosyltransferase IV; HSF1; he
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; NAFLD; nonalcoholic fatty liver disease; NASH; nonalcoholic steatohepatitis; Nrf2; nuclear factor erythroid 2-related factor 2; Keap1; Kelch-like ECH associated protein 1; TUNEL; terminal deoxynucleotidyl transferase dUTP nick end labeling; MTT; 3-(4,5-di
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; AA; Ascorbic acid; AEM1; ARE expression modulator 1; AEG1; Astrocyte elevated gene-1; Akt; Protein kinase B; AMPK; AMP-activated protein kinase; APL; Acute promyelocytic leukemia; ARE; Antioxidant response element; ATO; Arsenic trioxide; Bach; BTB and CNC