آشنایی با موضوع

منظور از siRNA مکانیسم خاموشی قوی و اختصاصی ژن است که توسط RNAدو رشته ای درونزاد (miRNA)یا برونزاد (siRNA)ایجاد می شود. اثرات RNAiبرای اولین بار توسط Napoliو همکارانش (در سال ۱۹۹1، به عنوان نتیجه تلاش آنها برای افزایش بیان کالکون سنتتاز (chalcone synthetase،CHS)،آنزیمی که تا حد زیادی مسئول رنگ گیاهی در گل اطلسی است، گزارش شد. برای مولکول های شکسته شده RNAدو مسیر وجود دارد: 1-RNAهای ناقص توسط ریبونوکلئازها تجزیه شوند 2-روی رشته هایی که با آنها همولوژی دارند، قرار گیرند و توسط RNAپلی مراز وابسته به RNAمجدداً دو رشته ای شده که در این صورت موجب تداوم مسیر RNAiمی شوند. SiRNA که یکی از انواع RNAi است امروزه کاربرد بسیاری پیدا کرده است. در این روش از توالی های دو رشته ای کوتاه RNA استفاده میشود. SiRNA مولکول های دو رشته ای RNA به طول 21 تا 25 نوکلئوتید هستند که توالی مکمل ژن مورد نظر را دارد و به صورت اختصاصی باعث کاهش ترجمه mRNA و تجزیه آن میشود. مکانیسم عمل این مولکول به این صورت است که مولکول dsRNA توسط یک آنزیم ریبونوکلئاز 3 به نام دایسر بریده میشود و یک توالی دو رشته ای 22 نوکلئوتیدی که در هر رشته در سمت 3 از رشته مقابل بلندتر است ایجاد میشود. این مولکول سپس به کمپلکس Risc متصل میشود این کمپلکس توسط آنزیم RNA هلیکاز مولکول SiRNA را تک رشته کرده و فقط رشته آنتی سنس داخل کمپلکس باقی می ماند. کمپلکس Risc که دارای رشته RNA آنتی سنس است به مولکول MRNA داخل سیتوپلاسم که توالی مکمل آن را داشته باشند متصل میشود. این اتصال علاوه بر جلوگیری از ترجمه باعث ایجاد یک برش در ساختار MRNA در فاصله 10 نوکلئوتید از انتهای ´5 مولکول SiRNA متصل شده میشود. این برش سبب میشود دیگر انتهای ´3 محافظت نشده و باعث ناپایداری ساختار MRNA و تجزیه آن شود و یا به صورت DNA داخل یک حامل وارد سلول شده و پس از رونویسی به صورت shRNA توسط دایسر بریده شده و به مسیر SiRNA وارد میشود. در چند سال گذشته پیشرفتهای فوق العاده ای در روش های خاموش سازی ژن براساس RNAinterference ایجاد شده و محققان از آن جهت خاموش سازی ژن بهره میبرند امروزه مشخص شده که میتوان از RNAi در زمینه های مختلفی از قبیل شناسایی مسیرهای پیام رسانی (signaling)، شناسایی عملکرد ژنها و درمان بیماری استفاده کرد. در طراحی siRNA باید معیارهای زیر رعایت گردد: 1- طول مولکول siRNA: siRNA موثر21 bp طول داشته و دارای آویزه 2 یا 3 بازی هستند 2- توالی مولکول siRNA: توصیه شده که بهتر است توالی های هدف siRNA به صورت AA (N19) TT باشد. علاوه بر این پیشنهاد شد که آویزه نیز توالی UU یا TT داشته باشد. 3- درصد GC مولکول siRNA: مطلوب است که محتوای GC مولکول حدوداً 35 تا 60 درصد باشد. 4- ناحیه مورد هدف siRNA در mRNA : ایده آل این است که در ناحیه ORF 1 باشد شناسایی بهترین توالی هدف یک پروسه امتحانی و آزمایشی است و تعدادی از siRNA باید علیه مکان های متفاوت در یک مولکول mRNA خاص آزمایش شود توصیه شده که نوکلئوتیدهای 75 تا 100 ابتدایی از هر mRNA پتانسیل لازم به عنوان مکان هدف کارآمد را ندارد زیرا نوکلئوتیدهای 75 تا 100 ابتدایی ممکن است در ناحیه UTR´5 مولکول mRNA باشند که در این شاید پروتئین های متصل شونده به mRNA حضور داشته باشند و میتوانند در عملکرد siRNA تداخل ایجاد کنند. 5- ارجحیت مکانی برای Risc: گزارش شده که ارجحیت مکانی باعث میشود که تنها یک رشته از siRNA دو رشته ای Risc شرکت یابد در این حالت ترجیحاً رشته آنتی سنس از siRNA به Risc متصل میشود معلوم شده زمانی که siRNA از لحاظ ترمودینامیکی ناپایدار باشند (غنی از ALU) یا سمت انتهای ´5 رشته آنتی سنس ناجورشدگی هایی (mismatch) وجود داشته باشد آن رشته ترجیحاً توسط Risc استفاده میشود در نتیجه بازدهی خاموش سازی افزایش میابد 6- اختصاصیت توالی هدف siRNA: جستجوی BIAST باید انجام شود تا توالی غیر اختصاصی شناسایی شوند 7- پیچیدگی توالی: از وجود سه آدنین و سه تیمین متوالی جلوگیری میشود زیرا سبب ختم زودرس رونویسی میشود. 8- نوع ارگانیسم: بستگی به اینکه موش، انسان، رت یا دروزوفیلا باشد طراحی متفاوت خواهد بود در مجموع siRNA مناسب 19 نوکلئوتید طول داشته که در سر هر ´3 خود نیز آویزه 12 اوریدینی یا دزوکسی تیمیدینی دارد از این رو توالی هدف همیشه با دو آدنین شروع میشود که مکمل با آویزه در اوریدین رشته آنتی سنس siRNA است.
در این صفحه تعداد 2716 مقاله تخصصی درباره siRNA که در نشریه های معتبر علمی و پایگاه ساینس دایرکت (Science Direct) منتشر شده، نمایش داده شده است. برخی از این مقالات، پیش تر به زبان فارسی ترجمه شده اند که با مراجعه به هر یک از آنها، می توانید متن کامل مقاله انگلیسی همراه با ترجمه فارسی آن را دریافت فرمایید.
در صورتی که مقاله مورد نظر شما هنوز به فارسی ترجمه نشده باشد، مترجمان با تجربه ما آمادگی دارند آن را در اسرع وقت برای شما ترجمه نمایند.
مقالات ISI siRNA (ترجمه نشده)
مقالات زیر هنوز به فارسی ترجمه نشده اند.
در صورتی که به ترجمه آماده هر یک از مقالات زیر نیاز داشته باشید، می توانید سفارش دهید تا مترجمان با تجربه این مجموعه در اسرع وقت آن را برای شما ترجمه نمایند.
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; Ketamine; microRNA; Prefrontal cortex; Small interfering RNA; RNA interference; 5-HT; serotonin; 5-HT1A receptor; serotonin 1A receptor; A1; adenosine A1 receptor; AchE; acetylcholinesterase; AGO; argonaute; Akt-mTOR; protein kinase B/Akt- mammalian targe
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; Asthma; house dust mite; glycolysis; IL-1; inhibitor of κB kinase ε; lactate; lactate dehydrogenase A; AHR; Airways hyperresponsiveness; BAL; Bronchoalveolar lavage; BMI; Body mass index; DC; Dendritic cell; 2-DG; 2-Deoxyglucose; ECAR; Extracellular aci
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; ALT; Alanine aminotransferase; AST; Aspartate aminotransferase; AUC; Area under the curve; BW; body weight; DMEM; Dulbecco's modified Eagle's medium; ER; endoplasmic-reticulum; FBS; fetal bovine serum; FFA; free fatty acid; GCK; glucokinase; p-GSK3β; pho
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; AMPA; α-amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole propionate; CPS; cumulative pain score; PSD-95; postsynaptic density protein 95; PWT; paw withdrawal threshold; siRNA; small interfering ribonucleic acid; TTBS; Tween/Tris-buffered saline solution; postoperati
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; Aldo; Aldosterone; MR; mineralocorticoid receptor; GR; glucocorticoid receptor; pHi; intracellular pH; pHirr; intracellular pH recovery rate; NHE1; basolateral Na+/H+ exchanger isoform 1; [Ca2+]i; cytosolic free calcium concentration; PLC; phospholipase C
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; αMHC-Cre; α-myosin heavy chain promoter-driven Cre recombinase; BCL2L13; Bcl-2-like protein 13; CCCP; mitochondrial uncoupler carbonyl cyanide m-chlorophenylhydrazone; ER; endoplasmic reticulum; FKBP8; FK506-binding protein 8; GRP78; glucose-regulated p
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; Apoptosis; β cells; Inflammation; Lysine demethylases; Gene expression; Diabetes; ATF; Activating transcription factor; ChIP; Chromatin immunoprecipitation; CHOP; C/EBP homologous protein; DP; Death promoting gene; ER; Endoplasmic reticulum; FDH; Formald
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; α3eKO; integrin α3 epidermal knockout; α9eKO; integrin α9 epidermal knockout; α3/α9eKO; integrin α3/α9 double epidermal knockout; BM; basement membrane; ECM; extracellular matrix; LN; laminin; LNγ2; laminin-γ2; MK; mouse keratinocyte; siRNA; sma
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; ac-lys; acetylated lysine; ac-Siah2; acetylated Siah2; ac-K139 Siah2; acetylated K139 Siah2; ASB2; a suppressor of cytokine signalling box 2 gene; cag; cytotoxin-associated gene; CHIP; C-terminus of Hsc70 interacting protein; DAPI; 4',6-Diamidino-2-phenyl
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; BMM; bone marrow-derived macrophages; M-CSF; macrophage-colony stimulating factor; miR; microRNA; miR-155; microRNA-155; MNC; multinucleated cells; OC; osteoclast; PBS; phosphate-buffered saline; qPCR; quantitative polymerase chain reaction; RANKL; recept
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; Colon Cancer; Familial Colorectal Cancer; Protein Translation; Mechanism; CRC; colorectal cancer; LOH; loss of heterozygosity; MAF; minor allele frequency; miRNA; microRNA; MMR; DNA mismatch repair; PBS; phosphate-buffered saline; PCR; polymerase chain re
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; GNR; gold nanorods; siRNA; small interfering RNA; siBRAF; siRNA specific for BRAF; FA; folic acid; CTAB; cetyltrimethylammonium bromide; MUA; mercaptoundecanoic acid; PEI; polyethylene imine; TEM; transmission electron microscope; NMR; nuclear magnetic re
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; Cancer resistance; Ferroptosis; Nutrient-deprivation autophagy factor-1; System xc-cystine/glutamate antiporter; Pioglitazone; CISD; CDGSH iron sulfur domain; ER; endoplasmic reticulum; FTH1; ferritin heavy chain 1; GPX4; glutathione peroxidase 4; GSH; gl
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; Mig6; Mitogen-inducible gene 6; EGF; epidermal growth factor; EGFR; epidermal growth factor receptor; RTK; Receptor tyrosine kinase; WT; Wild type; 19del; EGFR (del E746-A750); L858R; EGFR substitution of leucine to arginine residue 858; SILAC; stable i
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; Angiotensin II; Vascular smooth muscle cell (VSMC); Sphingosine-1-phosphate receptor (S1PR); APE/Ref-1; Vascular neointima; DCF-DA; 6-carboxy-2′,7′-dichlorofluoroscein diacetate; Ang II; angiotensin II; AT; Ang II receptor; APE/Ref-1; apurinic/apyrimi