آشنایی با موضوع

منظور از siRNA مکانیسم خاموشی قوی و اختصاصی ژن است که توسط RNAدو رشته ای درونزاد (miRNA)یا برونزاد (siRNA)ایجاد می شود. اثرات RNAiبرای اولین بار توسط Napoliو همکارانش (در سال ۱۹۹1، به عنوان نتیجه تلاش آنها برای افزایش بیان کالکون سنتتاز (chalcone synthetase،CHS)،آنزیمی که تا حد زیادی مسئول رنگ گیاهی در گل اطلسی است، گزارش شد. برای مولکول های شکسته شده RNAدو مسیر وجود دارد: 1-RNAهای ناقص توسط ریبونوکلئازها تجزیه شوند 2-روی رشته هایی که با آنها همولوژی دارند، قرار گیرند و توسط RNAپلی مراز وابسته به RNAمجدداً دو رشته ای شده که در این صورت موجب تداوم مسیر RNAiمی شوند. SiRNA که یکی از انواع RNAi است امروزه کاربرد بسیاری پیدا کرده است. در این روش از توالی های دو رشته ای کوتاه RNA استفاده میشود. SiRNA مولکول های دو رشته ای RNA به طول 21 تا 25 نوکلئوتید هستند که توالی مکمل ژن مورد نظر را دارد و به صورت اختصاصی باعث کاهش ترجمه mRNA و تجزیه آن میشود. مکانیسم عمل این مولکول به این صورت است که مولکول dsRNA توسط یک آنزیم ریبونوکلئاز 3 به نام دایسر بریده میشود و یک توالی دو رشته ای 22 نوکلئوتیدی که در هر رشته در سمت 3 از رشته مقابل بلندتر است ایجاد میشود. این مولکول سپس به کمپلکس Risc متصل میشود این کمپلکس توسط آنزیم RNA هلیکاز مولکول SiRNA را تک رشته کرده و فقط رشته آنتی سنس داخل کمپلکس باقی می ماند. کمپلکس Risc که دارای رشته RNA آنتی سنس است به مولکول MRNA داخل سیتوپلاسم که توالی مکمل آن را داشته باشند متصل میشود. این اتصال علاوه بر جلوگیری از ترجمه باعث ایجاد یک برش در ساختار MRNA در فاصله 10 نوکلئوتید از انتهای ´5 مولکول SiRNA متصل شده میشود. این برش سبب میشود دیگر انتهای ´3 محافظت نشده و باعث ناپایداری ساختار MRNA و تجزیه آن شود و یا به صورت DNA داخل یک حامل وارد سلول شده و پس از رونویسی به صورت shRNA توسط دایسر بریده شده و به مسیر SiRNA وارد میشود. در چند سال گذشته پیشرفتهای فوق العاده ای در روش های خاموش سازی ژن براساس RNAinterference ایجاد شده و محققان از آن جهت خاموش سازی ژن بهره میبرند امروزه مشخص شده که میتوان از RNAi در زمینه های مختلفی از قبیل شناسایی مسیرهای پیام رسانی (signaling)، شناسایی عملکرد ژنها و درمان بیماری استفاده کرد. در طراحی siRNA باید معیارهای زیر رعایت گردد: 1- طول مولکول siRNA: siRNA موثر21 bp طول داشته و دارای آویزه 2 یا 3 بازی هستند 2- توالی مولکول siRNA: توصیه شده که بهتر است توالی های هدف siRNA به صورت AA (N19) TT باشد. علاوه بر این پیشنهاد شد که آویزه نیز توالی UU یا TT داشته باشد. 3- درصد GC مولکول siRNA: مطلوب است که محتوای GC مولکول حدوداً 35 تا 60 درصد باشد. 4- ناحیه مورد هدف siRNA در mRNA : ایده آل این است که در ناحیه ORF 1 باشد شناسایی بهترین توالی هدف یک پروسه امتحانی و آزمایشی است و تعدادی از siRNA باید علیه مکان های متفاوت در یک مولکول mRNA خاص آزمایش شود توصیه شده که نوکلئوتیدهای 75 تا 100 ابتدایی از هر mRNA پتانسیل لازم به عنوان مکان هدف کارآمد را ندارد زیرا نوکلئوتیدهای 75 تا 100 ابتدایی ممکن است در ناحیه UTR´5 مولکول mRNA باشند که در این شاید پروتئین های متصل شونده به mRNA حضور داشته باشند و میتوانند در عملکرد siRNA تداخل ایجاد کنند. 5- ارجحیت مکانی برای Risc: گزارش شده که ارجحیت مکانی باعث میشود که تنها یک رشته از siRNA دو رشته ای Risc شرکت یابد در این حالت ترجیحاً رشته آنتی سنس از siRNA به Risc متصل میشود معلوم شده زمانی که siRNA از لحاظ ترمودینامیکی ناپایدار باشند (غنی از ALU) یا سمت انتهای ´5 رشته آنتی سنس ناجورشدگی هایی (mismatch) وجود داشته باشد آن رشته ترجیحاً توسط Risc استفاده میشود در نتیجه بازدهی خاموش سازی افزایش میابد 6- اختصاصیت توالی هدف siRNA: جستجوی BIAST باید انجام شود تا توالی غیر اختصاصی شناسایی شوند 7- پیچیدگی توالی: از وجود سه آدنین و سه تیمین متوالی جلوگیری میشود زیرا سبب ختم زودرس رونویسی میشود. 8- نوع ارگانیسم: بستگی به اینکه موش، انسان، رت یا دروزوفیلا باشد طراحی متفاوت خواهد بود در مجموع siRNA مناسب 19 نوکلئوتید طول داشته که در سر هر ´3 خود نیز آویزه 12 اوریدینی یا دزوکسی تیمیدینی دارد از این رو توالی هدف همیشه با دو آدنین شروع میشود که مکمل با آویزه در اوریدین رشته آنتی سنس siRNA است.
در این صفحه تعداد 2716 مقاله تخصصی درباره siRNA که در نشریه های معتبر علمی و پایگاه ساینس دایرکت (Science Direct) منتشر شده، نمایش داده شده است. برخی از این مقالات، پیش تر به زبان فارسی ترجمه شده اند که با مراجعه به هر یک از آنها، می توانید متن کامل مقاله انگلیسی همراه با ترجمه فارسی آن را دریافت فرمایید.
در صورتی که مقاله مورد نظر شما هنوز به فارسی ترجمه نشده باشد، مترجمان با تجربه ما آمادگی دارند آن را در اسرع وقت برای شما ترجمه نمایند.
مقالات ISI siRNA (ترجمه نشده)
مقالات زیر هنوز به فارسی ترجمه نشده اند.
در صورتی که به ترجمه آماده هر یک از مقالات زیر نیاز داشته باشید، می توانید سفارش دهید تا مترجمان با تجربه این مجموعه در اسرع وقت آن را برای شما ترجمه نمایند.
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; AA; arachidonic acid; ABCD1; ATP-binding cassette transporter subfamily D member 1; AlkCho; plasmanylcholine; AOx; acyl-CoA oxidase1; CG; complementation group; CHO; Chinese hamster ovary; CNS; central nervous system; D-BP; D-bifunctional protein; DHA; do
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; Wound healing; TGF-β/Smad3 signal; Pirin; Artificial dermis graftTGF-β, transforming growth factor-β; IFN-γ, interferon γ; IFN-β, interferon β; RT-PCR, reverse transcription-polymerase chain reaction; GAPDH, glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase; siRNA
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; CHIT1; chitotriosidase; CHI3L1; chitinase 3-like-1; MMP9; matrix metallopeptidase 9; siRNA; small interfering RNA; CPhoDs; calcium phosphate thin film discs; DDs; dentin discs; Osteoclasts; Chitinases; Chitinase-like-proteins (CLPs); Osteolysis;
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; cAMP; adenosine 3′,5′-cyclic monophosphate; cGMP; guanosine 3′,5′-cyclic monophosphate; dnPDE2A; a catalytically-dead mutant of PDE2; EHNA; erythro-9-(2-hydroxy-3-nonyl)adenine; FBS; fetal bovine serum; MTS; 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-5-(3-carbo
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; 3-MA; 3-methyladenine; STZ; streptozotocin; TBG; tail blood glucose; CHOP; CCAAT-enhancer-binding protein homologous protein; siRNA; small interfering RNA; ER; endoplasmic reticulum; Autophagy; Apoptosis; Endoplasmic reticulum stress; Podocyte;
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; BrdU; 5-boromo-2'-deoxyuridine; BSA; bovine serum albumin; DMEM; Dulbecco׳s modified Eagle medium; DMS; D-erythro-N,N-dimethylsphingosine; DMSO; dimethyl sulfoxide; EDL; extensor digitorum longus; EDG; endothelial differentiation gene; EGF; epidermal gro
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; AKI; acute kidney injury; ApoE; apolipoprotein E; a.u.; arbitrary units; AUC; area under the curve; Alix; ALG-2-interacting protein X; Chol; cholesterol; DLin-MC3-DMA; heptatriaconta-6,9,28,31-tetraen-19-yl 4-(dimethylamino)butanoate; DSPC; 1,2-distearoyl
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; AD; Alzheimer's disease; ALD; X-linked adrenoleukodystrophy; ALDRP; adrenoleukodystrophy-related protein; ALDP; adrenoleukodystrophy protein; ALS; amyotrophic lateral sclerosis; ATF-2; activating transcription factor 2; BBB; blood-brain barrier; AP-1; a
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; ASK1; apoptosis signal-regulating kinase 1; ATF4; activating transcription factor 4; ATF6; activating transcription factor 6; Bcl-2; B-cell lymphoma 2; BiP; binding immunoglobulin protein; bZIP; basic leucine zipper; CDK; cyclin-dependent kinase; CDKI; CD
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; The circadian clock; mast cells; IgE; allergy; mouse; BMCMC; Bone marrow-derived cultured mast cell; ChIP; Chromatin immunoprecipitation; mMCP; Mouse mast cell protease; PCA; Passive cutaneous anaphylaxis; PER2::LUC; Period2::Luciferase; siRNA; Small in
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; AAV1; adeno-associated virus serotype 1; ACC; American College of Cardiology; ACCELERATE; A Study of Evacetrapib in High-Risk Vascular Disease; ACCORD; Action to Control Cardiovascular Risk in Diabetes; ADA; American Diabetes Association; AMP; adenosine m
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; A-LAP; adipocyte-derived leucine aminopeptidase; APN; aminopeptidase N; HUVEC; human umbilical vein endothelial cells; VEGF; vascular endothelial growth factor; siRNA; small interfering RNA; Adipocyte-derived leucine aminopeptidase (A-LAP); Drug screening
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; GFs; growth factors; ALG; alginate; HA; hyaluronic acid; HEP; heparin; PEI; polyethyleneimine; PHEMA; poly(2-hydroxyethyl methacrylate); PEG; poly(ethylene glycol); PEO; poly(ethylene oxide); DEX; dextran; PPO; poly(propylene oxide); PPG; poly(propylene g
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; ARE; antioxidant response element; CBP; CREB-binding protein; ChIP; chromatin immunoprecipitation; co-IP; coimmunoprecipitation; GCL; glutamate-cysteine ligase; Gclc; GCL catalytic subunit; Gclm; GCL modifier subunit; GSH; reduced glutathione; GS; GSH s
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; DMA; 2-(dimethylamino)ethyl methacrylate; QDMA; quaternized 2-(dimethylamino)ethyl methacrylate; DEA; 2-(diethylamino)ethyl methacrylate; DPA; 2-(diisopropylamino)ethyl methacrylate; MEMA; N-(morpholino)ethyl methacrylate; FOMA; fluorooctyl methacrylate;
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; ALAS1; δ-aminolevulinate synthase 1; ANGPTL3; angiopoietin-like 3; FVII; factor VII; FXI; factor XI; GCGR; glucagon receptor; HCC; hepatocellular carcinoma; HCV; hepatitis C virus; HoFH; homozygous familial hypercholesterolemia; KSP; kinesin spindle prot
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; TRL; triglyceride-rich lipoproteins; ApoB48R; apolipoprotein-B48 receptor; HPSO; high-palmitic sunflower oil; ROO; olive oil; VEFO; mixture of vegetable and fish oils; SFA; saturated fatty acids; MUFA; monounsaturated fatty acids; PMA; phorbol 12-myristat
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; CNS; central nervous system; DAT; dopamine transporter; GABA; gamma-aminobutyric acid; GAT; gamma-aminobutyric acid (GABA) transporter; GLT; glutamate transporter; iDAT; invertebrate dopamine transporter; NAT; noradrenaline transporter; NTT; neurotransmit
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; FOXO; forkhead box O; GC; glucocorticoids; MuRF-1; muscle RING-finger protein-1; mTOR; mammalian target of rapamycin; IGF-I; Insulin-like Growth Factor-I; eIF4E; eukaryotic translation initiation factor 4E; S6K1; ribosomal protein kinase 1; 4E-BP1; eukary
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; HRE; hypoxia-responsive element; HIF-1; hypoxia-inducible factor-1; MTT; 3-[4,5-dimethylthiazol-2-yl]-2,5-diphenyltetrazolium bromide; siRNA; small interfering RNA; AMPK; 5′-adenosine monophosphate-activated protein kinase; PBS; phosphate buffered sal
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; AD; Alzheimer's disease; AQP; aquaporin; ATP; adenosine triphosphate; BBB; blood-brain barrier; BSA; bovine serum albumin; CaMK; Ca2+/calmodulin-dependent protein kinases; CNS; central nervous system; EAE; experimental autoimmune encephalomyelitis; ER;
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; ATM; Ataxia Telangiectasia Mutated gene; siRNA; small interfering RNA; SRSF; SR splicing factor; hnRNP; Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins; LMNA; Lamin A/C gene; qRT-PCR; quantitative real-time PCR; TLDA; TaqMan Low Density Array; RT-PCR; Reverse Tr
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; RPMCs; rat peritoneal mesothelial cells; HPMCs; human peritoneal mesothelial cells; HG; high glucose; ZnT; zinc transporter; CAPD; continuous ambulatory peritoneal dialysis; ESRD; end-stage renal disease; CKD; chronic kidney disease; DMEM; Dulbecco's modi
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; MSCs; mesenchymal stem cells; BMSCs; bone marrow-derived mesenchymal stem cells; ASCs; adipose-derived stem cells; MDSCs; muscle-derived stem cells; EPCs; endothelial progenitor cells; EC; endothelial cells; iPSCs; induced pluripotent stem cells; ECM; ext
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; ABC; ATP-binding cassette; ACM; astrocyte conditioned medium; Apo; apolipoprotein; DIV; day in culture; HC; hydroxycholesterol; LXR; liver X receptor; PDL; poly-d-lysine; RA; retinoic acid; RXR; retinoid X receptor; siRNA; small interfering RNA; Neurons;
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; AML; acute myeloid leukemia; CAM-DR; cell adhesion-mediated drug resistance; CCP; charge-conversion polymer; CLL; chronic lymphocytic leukemia; CNS; central nervous system; CSC; cancer stem cell; EGFR; epidermal growth factor receptor; EPR; enhanced perme
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; AMC; ameboid microglial cells; CNS; central nervous system; CRMPs; collapsin response mediator proteins; DAPI; 4′,6-diamidino-2-phenylindol; Dpysl3; dihydropyrimidinase like 3; F-actin; filamentous actin; IL-1β; interleukin-1 beta; iNOS; inducible nitr
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; AEBS; antiestrogen binding site; ChEH; cholesterol epoxide hydrolase; Tam; tamoxifen, trans-2-[4-(1,2-diphenyl-1-butenyl)phenoxy]-N,N-dimethylethylamine; 4OH-tam; 4-[(Z)-1-[4-(2-dimethylaminoethyloxy)phenyl]-2-phenylbut-1-enyl]phenol; Ralox; raloxifene, [
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; ABC; adenosine triphosphate (ATP)-binding cassette; ASO; antisense oligonucleotides; CPT; camptothecin; DBD; drug-binding domain; DDS; drug delivery system; DOX; doxorubicin; EPR; enhanced permeability and retention effect; IC50 dose; a dose that kills 50
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; siRNA; small interfering RNA; AON; antisense oligonucleotides; shRNA; small hairpin RNA; pDNA; plasmid DNA; CYP3A; cytochrome P450 3A; MDR; multidrug resistance; MDR1; multidrug resistance protein 1; Pgp; P-glycoprotein; TRAIL; tumor necrosis factor-relat
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; ATF-4; activating transcription factor-4; ARNT; aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator; bHLH; basic helix-loop-helix; BBB; Basso, Beattie, and Bresnahan; cFLIP; cellular FLICE-inhibitory protein; cyt C; cytochrome C; Cygb; cytoglobin; CYP2B6; cyto
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; AFm; mono aluminate ferrite; A549; adenocarcinomic human alveolar basal epithelial cell line; C3A; tricalcium aluminate; C4AF; tetracalcium aluminoferrite; CEC; cationic exchange capacity; CLA; conjugated linoleic acids; CNT; carbon nanotubes; DBS; dodecy
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; AAV; adeno-associated viruses; Ad6; adenovirus serotype 6; ABCB5 +; ATP-binding cassette sub-family B member 5; ALDH; aldehyde dehydrogenase; AML; acute myeloid leukemia; APCs; antigen presenting cells; B7.1; (CD80) cluster of differentiation 80; BCG; Ba
Elsevier - ScienceDirect - الزویر - ساینس دایرکت
Keywords: siRNA; MC-LR; Microcystin-LR; PI3-K/AKT; Phosphatidylinositol 3-kinase/Akt; PP1 and PP2A; Protein phosphatase type 1 and type 2A; qPCR; Quantitative real-time polymerase chain reaction; STAT3; Signal transducer and activator of transcription 3; siRNA; Small inte